基底细胞癌与黑色素瘤基因表达数据的比较研究

该数据集来自 plos.figshare.com,包含 10 个文件,以 PDF 图表形式呈现基底细胞癌与黑色素瘤的基因表达比较分析结果

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2023-05-30 更新
浏览 13
基因组分类comparativegene-expressionbasalcarcinomamelanomarevealsinsightscancers
A Comparative Study of Gene-Expression Data of Basal Cell Carcinoma and Melanoma Reveals New Insights about the Two Cancers

基本信息

模态
基因组
大小
0.007468546 GB
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2023-05-30
版本
v1

资源简介

基底细胞癌与黑色素瘤基因表达数据的比较研究

A Comparative Study of Gene-Expression Data of Basal Cell Carcinoma and Melanoma Reveals New Insights about the Two Cancers

该数据集来自 plos.figshare.com,包含 10 个文件,以 PDF 图表形式呈现基底细胞癌与黑色素瘤的基因表达比较分析结果。研究对比了两种皮肤癌及其他癌症类型的基因组尺度转录组数据,重点考察能量代谢、细胞侵袭与转移等通路,旨在识别导致或促进黑色素瘤侵袭性的关键调控因子。数据可用于皮肤癌分子机制研究、基因表达比较分析及相关通路探索(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《A Comparative Study of Gene-Expression Data of Basal Cell Carcinoma and Melanoma Reveals New Insights about the Two Cancers》发表于 PLoS ONE(2012),DOI:10.1371/journal.pone.0030750。源站首次发布:2012-01-25。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):对两种皮肤癌(黑色素瘤和基底细胞癌)的基因组尺度转录组数据与其他癌症类型进行了比较分析,目的是识别导致或促进黑色素瘤侵袭性的关键调控因子,而基底细胞癌通常保持为一种温和的疾病。研究考虑了多种癌症相关通路,如细胞增殖、凋亡、血管生成、细胞侵袭和转移,但重点放在能量代谢、细胞侵袭和转移通路上。我们的发现包括以下内容。(a) 两种皮肤癌都同时使用糖酵解和增强的氧化磷酸化(电子传递链)来供应能量。(b) 晚期黑色素瘤显示参与脂肪酸代谢(β-氧化)和氧化磷酸化的关键基因显著上调,伴随有氧

【数据结构与技术规格】

文件数 10 个,合计 7.47 MB。数据集 DOI:10.1371/journal.pone.0030750。

【主题与分类】

源站学科分类:Developmental Biology、Mathematics、Biological Sciences、Cancer、Genetics。主题标签:comparative、gene-expression、basal、carcinoma、melanoma、reveals、insights、cancers。本站分类:肿瘤/皮肤癌。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Developmental Biology、Mathematics、Biological Sciences、Cancer、Genetics。

【获取与许可】

源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/A_Comparative_Study_of_Gene_Expression_Data_of_Basal_Cell_Carcinoma_and_Melanoma_Reveals_New_Insights_about_the_Two_Cancers/129362

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Xu, Kun; Mao, Xizeng; Mehta, Minesh; Cui, Juan; Zhang, Chi; Xu, Ying (2016). A Comparative Study of Gene-Expression Data of Basal Cell Carcinoma and Melanoma Reveals New Insights about the Two Cancers. PLOS ONE. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-05-30,引用时请注意版本时效。

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curl -L -o "Figure_S4.pdf" "https://ndownloader.figshare.com/files/351006"
curl -L -o "Figure_S5.pdf" "https://ndownloader.figshare.com/files/351041"
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curl -L -o "Table_S2.pdf" "https://ndownloader.figshare.com/files/351312"
curl -L -o "Table_S3.pdf" "https://ndownloader.figshare.com/files/351424"

文件清单

  • Figure_S1.pdf(233.78 KB)
  • Figure_S2.pdf(258.24 KB)
  • Figure_S3.pdf(295.61 KB)
  • Figure_S4.pdf(353.20 KB)
  • Figure_S5.pdf(458.75 KB)
  • Table_S1.pdf(2.22 MB)
  • Table_S2.pdf(446.05 KB)
  • Table_S3.pdf(370.51 KB)
  • Table_S4.pdf(22.69 KB)
  • Table_S5.pdf(2.81 MB)

文件总体积 7.47 MB(源站 API 实测)。

数据说明

对两种皮肤癌——黑色素瘤和基底细胞癌——的基因组规模转录组数据与其他癌症类型进行了比较分析,旨在识别导致或促成黑色素瘤侵袭性的关键调控因子,而基底细胞癌通常保持为一种温和的疾病。研究考虑了多种癌症相关通路,如细胞增殖、凋亡、血管生成、细胞侵袭和转移,但我们的重点在于能量代谢、细胞侵袭和转移通路。我们的发现包括以下几点。(a) 两种皮肤癌均同时利用糖酵解和增强的氧化磷酸化(电子传递链)来供应能量。(b) 晚期黑色素瘤显示参与脂肪酸代谢(β-氧化)和氧化磷酸化的关键基因显著上调,有氧代谢的效率远高于无氧糖酵解,为支持该癌症的快速生长提供了必要的能量来源。

© 尽管晚期黑色素瘤在促进细胞侵袭和转移的基因活性水平上与胰腺癌相似,但基底细胞癌的主要转移形式在这种活性上显著降低,部分解释了为何这种癌症类型被认为远不如前者侵袭性强。我们采用的方法,即聚焦于特定通路,对多种癌症类型的转录组数据进行对比分析,为癌症研究提供了一种新颖且高效的一般性方法。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0030750(source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/A_Comparative_Study_of_Gene_Expression_Data_of_Basal_Cell_Carcinoma_and_Melanoma_Reveals_New_Insights_about_the_Two_Cancers/129362)。

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