GSE291257镰状细胞病疼痛事件转录组数据集
包含SCD个体稳态和疼痛住院期间外周血转录组数据,用于疼痛事件相关分析。由NCBI Gene Expression Omnibus提供,来自GEO,数据格式为表格,包含174条数据记录,适用于分类任务,专注于肿瘤领域的镰状细胞贫血研究。

基本信息
资源简介
GSE291257镰状细胞病疼痛事件转录组数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Gene Expression Profiling Identifies Potential Biomarkers for Vaso-Occlusive Episodes in Sickle Cell Disease》。源站首次发布:Mar 06 202。
【数据内容】
源站原始描述:Vaso-occlusive episodes (VOE) or acute pain events, involving complex interactions between sickle erythrocytes and other blood cells, are a hallmark symptom of sickle cell disease (SCD). In this study, we analyzed changes in peripheral blood transcriptomes between steady state and VOE in individuals with SCD. We followed a cohort of 174 individuals with SCD with or without chronic pain and collected peripheral blood at clinic visits (steady state) and during hospitalizations (VOE). We performed…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by high throughput sequencing、GPL24676、9606。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE291257
【使用注意】
· 源站最后修改于 Nov 26 202,引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE291257
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
包含SCD个体稳态和疼痛住院期间外周血转录组数据,用于疼痛事件相关分析。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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