GSE232221镰状细胞网织红细胞RNA测序数据集

包含镰状细胞病相关网织红细胞及红细胞RNA表达数据,用于表达变化分析。由NCBI Gene Expression Omnibus提供,来自GEO,数据格式为表格,适用于分类任务,专注于肿瘤领域的镰状细胞贫血研究。

NCBI Gene Expression OmnibusNCBI Gene Expression Omnibus
GEO
2023-01-01 更新
浏览 16
表格分类GPL203019606
GSE232221 Sickle Cell Reticulocyte RNA-seq Dataset

基本信息

模态
表格
大小
0.000214016 GB
任务类型
分类
创建/更新时间
2023-01-01

资源简介

GSE232221镰状细胞网织红细胞RNA测序数据集

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Gene Expression Changes in Sickle Cell Reticulocytes and their Clinical Associations》。源站首次发布:May 10 202。

【数据内容】

源站原始描述:Transcriptional changes in compensatory erythropoiesis in sickle cell anemia (SCA) and their disease modulation are unclear. We detected 1226 differentially expressed genes in hemoglobin SS reticulocytes compared to non-anemic hemoglobin AA controls. Assessing developmental expression changes in hemoglobin AA erythroblasts for these genes suggests heightened terminal differentiation in early erythroblasts in SCA that diminishes toward the polychromatic to orthochromatic stage transition. Compari…

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by high throughput sequencing、GPL20301、9606。

【适用方向】

结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。

【获取与许可】

源站页面:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE232221

【使用注意】

· 源站最后修改于 Nov 09 202,引用时请注意版本时效。

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源站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE232221

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

包含镰状细胞病相关网织红细胞及红细胞RNA表达数据,用于表达变化分析。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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