CRC100K

这是一组 100,000 个非重叠图像块,来自人类结肠直肠癌 (CRC) 和正常组织的苏木精和伊红 (H&E) 染色组织学图像。 所有图像均为 224x224 像素 (px),每像素 0.5 微米 (MPP)。 用于组…

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2026-07-12 更新
浏览 18
医学影像结直肠癌组织学图像H&E染色图像分类病理学结肠直肠癌正常组织
CRC100K

基本信息

模态
医学影像
大小
23.12 GB
数据量
207180
创建/更新时间
2026-07-12

资源简介

CRC100K

【一句话概览】

CRC100K 包含 100,000 个非重叠图像块,取自人类结直肠癌及正常组织的 H&E 染色组织学图像,均为 224x224 像素、每像素 0.5 微米,用于组织分类,类别包括脂肪、背景、碎片、淋巴细胞、粘液、平滑肌、正常结肠黏膜、癌症相关基质和结直肠腺癌上皮。图像从 NCT 生物库和 UMM 病理档案的福尔马林固定石蜡包埋样本中手动提取,来自 86 例 H&E 染色人类癌症组织切片,涵盖原发肿瘤、肝转移及胃切除标本非肿瘤区域(来源 opendatalab.org.cn)。

【数据内容】

源站原始描述:这是一组 100,000 个非重叠图像块,来自人类结肠直肠癌 (CRC) 和正常组织的苏木精和伊红 (H&E) 染色组织学图像。 所有图像均为 224x224 像素 (px),每像素 0.5 微米 (MPP)。 用于组织分类;类别是:脂肪(ADI),背景(BACK),碎片(DEB),淋巴细胞(LYM),粘液(MUC),平滑肌(MUS),正常结肠粘膜(NORM),癌症相关基质(STR),结直肠腺癌上皮(TUM)。 这些图像是从 NCT 生物库(德国海德堡国家肿瘤疾病中心)和 UMM 病理档案(大学医学中心)的福尔马林固定石蜡包埋 (FFPE) 样本中手动提取的 N=86 H&E 染色的人类癌症组织切片曼海姆,曼海姆,德国)。组织样本包含 CRC 原发性肿瘤切片和来自 CRC 肝转移灶的肿瘤组织;胃切除标本中的非肿瘤区域增加了正常组织类别,以增加变异性。

中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):这是一组包含100,000个非重叠图像块的数据集,源自人类结肠直肠癌(CRC)及正常组织的苏木精和伊红(H&E)染色组织学图像。所有图像尺寸统一为224x224像素(px),空间分辨率为每像素0.5微米(MPP)。该数据集旨在用于组织分类任务,涵盖的类别有:脂肪(ADI)、背景(BACK)、细胞碎片(DEB)、淋巴细胞(LYM)、粘液(MUC)、平滑肌(MUS)、正常结肠粘膜(NORM)、癌症相关基质(STR)以及结直肠腺癌上皮(TUM)。这些图像是从德国海德堡国家肿瘤疾病中心(NCT)生物样本库和曼海姆大学医学中心(UMM)病理档案馆的福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)样本中,手工从N=86例H&E染色的人类癌症组织切片中提取的。组织样本包括CRC原发肿瘤切片及CRC肝转移灶的肿瘤组织;此外,胃切除标本中的非肿瘤区域被纳入以增加正常组织类别的多样性。

【主题与分类】

主题标签:结直肠癌、组织学图像、H&E染色、图像分类、病理学、结肠直肠癌、正常组织。

【适用方向】

影像类数据可用于医学图像分析模型(检测、分割、分类)的训练与评测,也可用于标注质量与成像参数相关性的研究。

【获取与许可】

源站页面:https://opendatalab.org.cn/OpenDataLab/CRC100K

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数据集获取

源站:https://opendatalab.org.cn/OpenDataLab/CRC100K

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 23.12 GB。

数据说明

该数据集包含10万张来自人类结直肠癌和正常组织的H&E染色组织学图像的非重叠图像块,尺寸为224×224像素,空间分辨率0.5微米/像素。用于组织分类任务,包含脂肪、背景、碎片、淋巴细胞、粘液、平滑肌、正常结肠粘膜、癌症相关基质和结直肠腺癌上皮共9个类别。图像源自NCT生物库和UMM病理档案的FFPE样本。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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