数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3A0efa2552fb0efcbe31fab7090040bdfef2407d369c8d20de97d6465607f21e9e

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

MHC-I缺失是前列腺癌（PCa）免疫逃逸和免疫治疗失败的标志性特征。本研究发现ZNF263是一种转录抑制因子，它通过将NuRD招募至STAT1启动子来沉默MHC-I，从而降低STAT1和MHC-I的表达。缺氧通过两种ZNF263修饰增强这种抑制作用：磷酸化驱动的相分离增强与NuRD的相互作用，以及S662位点的O-GlcNAc糖基化促进STAT1启动子结合。O-GlcNAc糖基化还促进PRKDC相互作用，放大磷酸化效应。ZNF263缺失可增强IFN-γ对MHC-I的诱导作用。计算机对接筛选鉴定出Viroptic为KRAB口袋结合物，可破坏ZNF263–NuRD相互作用，解除对STAT1的抑制，并在体内增强IFN-γ抗肿瘤免疫。ZNF263高表达与MHC-I低表达、CD8+ T细胞稀少及生存期差相关，为前列腺癌免疫治疗中靶向ZNF263提供了依据。

数据来源：ZNF263-NuRD介导的STAT1抑制削弱前列腺癌中MHC-I抗原呈递及IFN-γ疗效

数据集DOI：10.5061/dryad.bnzs7h4sr

数据与文件结构说明

本数据集包含为研究ZNF263在前列腺癌中的转录及表观遗传调控机制而生成的多组学测序数据。数据集包括由人LNCaP前列腺癌细胞生成的bulk RNA测序（RNA-seq）、ATAC-seq和CUT&Tag数据，以及由C57BL/6小鼠中建立的鼠源RM-1皮下肿瘤生成的bulk RNA-seq数据。体外数据集包括：转染si-NC或si-ZNF263的LNCaP细胞的RNA-seq计数矩阵；转染si-NC或si-ZNF263的LNCaP细胞的ATAC-seq信号轨迹；转染si-NC或si-ZNF263的LNCaP细胞的H3K27ac CUT&Tag信号轨迹；以及在DM…中使用IgG和ZNF263抗体生成的ZNF263 CUT&Tag信号轨迹。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。