TMPRSS2-ERG融合前列腺癌是侵袭性前列腺癌中分子独特的雌激素敏感亚类

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源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-8402

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数据说明

目前认为，常见的上皮性癌症通过多个独立分子事件的累积导致细胞信号传导失调，从而变得更具侵袭性。然而，大多数前列腺癌存在由雄激素调控的TMPRSS2启动子5‘-非翻译区与ETS转录因子家族成员形成的基因融合，这一发现使上述范式受到质疑1,2。TMPRSS2-ERG基因融合是前列腺癌最常见的分子亚型。近期研究表明，TMPRSS2-ERG融合与更具侵袭性的临床表型相关3。在雄激素受体已失活的最晚期去势抵抗性前列腺癌中，TMPRSS2-ERG融合仍保持功能活性。本文中，我们展示了有力的临床和基因表达数据，支持存在TMPRSS2-ERG融合前列腺癌亚型。通过对455例原发性前列腺肿瘤进行表达芯片分析，我们鉴定出一个87基因表达特征，可将TMPRSS2-ERG融合前列腺癌区分为一个独立的分子实体。

计算分析表明，该融合特征与雌激素受体信号传导相关。功能研究证实，雌激素类化合物可调控TMPRSS2-ERG融合转录本。这些数据揭示了一种此前未被认识到的TMPRSS2-ERG调控机制，即使在缺乏功能性雄激素受体的情况下亦然，因而可能对前列腺癌的治疗具有更广泛的意义。关键词：前列腺癌、表达芯片、Illumina、基因融合、TMPRSS2、ERG、特征、雌激素 测试队列：来自基于人群的瑞典观察等待队列的388例病例。该队列由局限性前列腺癌男性组成（临床分期T1-T2，Mx，N0）；验证队列：医师健康研究（PHS）队列纳入116名在1983年至2003年间被诊断为偶发性前列腺癌的美国男性；455例病例标注了TMPRSS2-

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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