局限性前列腺癌蛋白质组数据集，第7部分
该数据集来自 omicsdi.org，聚焦局限性前列腺癌的蛋白质组。研究对FFPE根治性前列腺切除标本进行全细胞蛋白提取，共包含28个肿瘤样本和8个相邻非恶性前列腺组织，用于表征腺体局限型前列腺肿瘤与非恶性前列腺组织的蛋白质组特征
基本信息
资源简介
局限性前列腺癌蛋白质组数据集，第7部分
该数据集名为 The proteome of localized prostate cancer, part 7，来源于 omicsdi.org，归类于肿瘤 / 前列腺癌方向，主题标签为 Proteomics。其核心内容是对局限性前列腺癌进行蛋白质组表征，研究对象为腺体局限型前列腺肿瘤组织与相邻非恶性前列腺组织。研究从 FFPE 根治性前列腺切除标本中提取全细胞蛋白，共纳入 28 个肿瘤样本和 8 个相邻非恶性前列腺组织，用于比较和分析两类组织的蛋白质组特征。该数据集关联的 ProteomeXchange 标识包括 PXD003430、PXD003452、PXD003515、PXD004132、PXD003615、PXD003636，便于用户追溯原始蛋白质组数据资源。
【数据集背景】
前列腺癌是男性常见的恶性肿瘤之一，其中局限性前列腺癌指肿瘤仍局限于前列腺腺体内部。对该阶段肿瘤组织与非恶性前列腺组织进行蛋白质组层面的系统比较，有助于理解肿瘤发生发展过程中蛋白质表达和修饰的变化。该数据集正是在这一背景下产生，聚焦于腺体局限型前列腺肿瘤的蛋白质组表征，旨在从蛋白质层面描述肿瘤组织与相邻非恶性组织之间的差异特征。
【数据内容】
该数据集的核心内容为蛋白质组数据，来源于对 FFPE 根治性前列腺切除标本的全细胞蛋白提取。样本包括 28 个肿瘤样本和 8 个相邻非恶性前列腺组织，合计 36 个样本。研究目标是对腺体局限型前列腺肿瘤与非恶性前列腺组织的蛋白质组进行表征。数据集主题标签为 Proteomics，本站分类为肿瘤 / 前列腺癌。除上述样本数量和组织类型外，源站未提供更详细的蛋白质鉴定数量、定量结果或具体分子列表。
【采集与来源】
样本采集自根治性前列腺切除标本，且为 FFPE 保存形式。研究人员对这些 FFPE 标本进行全细胞蛋白提取，获得可用于蛋白质组分析的蛋白样本。数据集来源站为 omicsdi.org，并关联多个 ProteomeXchange 标识：PXD003430、PXD003452、PXD003515、PXD004132、PXD003615、PXD003636。这些标识可用于在 ProteomeXchange 体系中定位相应的原始数据集。关于样本采集的具体时间、地点、伦理审批信息以及患者临床特征，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于局限性前列腺癌蛋白质组研究相关场景，包括肿瘤组织与相邻非恶性前列腺组织之间的蛋白质组比较分析、前列腺癌生物标志物探索的候选蛋白筛选，以及基于 FFPE 标本的蛋白质组学方法验证。由于样本明确区分肿瘤与非恶性组织，也可用于研究腺体局限型前列腺肿瘤的分子特征。主题标签 Proteomics 表明其适用于蛋白质组学数据分析流程。其他具体应用场景源站未提供。
【使用方法】
用户可通过 omicsdi.org 获取该数据集的描述信息，并利用关联的 ProteomeXchange 标识 PXD003430、PXD003452、PXD003515、PXD004132、PXD003615、PXD003636 访问相应的原始蛋白质组数据。使用时可结合蛋白质组学分析工具对肿瘤样本与相邻非恶性组织样本进行比较。关于数据下载格式、预处理步骤、分析参数及推荐软件，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集包含 28 个肿瘤样本和 8 个相邻非恶性前列腺组织，样本来源于 FFPE 根治性前列腺切除标本。FFPE 标本在蛋白质组学研究中可能涉及蛋白提取和修饰方面的技术考量，但源站未提供具体的质量控制指标、数据完整性评估或批次效应信息。关于样本的临床分期、分级、随访信息以及实验重复情况，源站未提供。因此，使用时应结合原始数据资源自行评估数据质量与适用性。
【引用与许可】
该数据集关联的 ProteomeXchange 标识为 PXD003430、PXD003452、PXD003515、PXD004132、PXD003615、PXD003636。关于数据集的引用方式、许可协议、使用条款以及是否允许再分发，源站未提供。建议用户在使用前查阅 omicsdi.org 及相应 ProteomeXchange 记录中的引用与许可说明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/massive/MSV000080056
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
局限于腺体的前列腺肿瘤与非恶性前列腺组织的蛋白质组特征分析。从FFPE根治性前列腺切除标本中纯化全细胞蛋白提取物，共包括28个肿瘤样本和8个相邻的非恶性前列腺组织。相关ProteomeXchange标识符：PXD003430、PXD003452、PXD003515、PXD004132、PXD003615、PXD003636。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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