局限性前列腺癌蛋白质组，第1部分
该数据集来自 omicsdi.org，主题为局限性前列腺癌的蛋白质组，属于肿瘤/前列腺癌分类。源站描述显示，研究对局限于腺体的前列腺肿瘤与非恶性前列腺组织进行了蛋白质组表征，从 FFPE 根治性前列腺切除标本中纯化全细胞蛋白提取物，共包含 28 个肿瘤样本和 8 个邻近非恶性前列腺组织
基本信息
资源简介
局限性前列腺癌蛋白质组，第1部分
该数据集名为 The proteome of localized prostate cancer, part 1，来源于 omicsdi.org，主题标签为 Proteomics，在分类上属于肿瘤 / 前列腺癌。其核心内容是对局限性前列腺癌进行蛋白质组层面的表征，研究对象包括局限于腺体的前列腺肿瘤组织以及非恶性前列腺组织。样本来自 FFPE 根治性前列腺切除标本，研究者从中纯化全细胞蛋白提取物，共纳入 28 个肿瘤样本和 8 个邻近非恶性前列腺组织。该数据集关联的 ProteomeXchange 标识包括 PXD003452、PXD003515、PXD004132、PXD003615、PXD003636 和 PXD004159。整体来看，它为局限性前列腺癌的蛋白质组研究提供了以临床组织标本为基础的数据资源，可用于比较肿瘤与非恶性前列腺组织在蛋白质表达层面的差异。
【数据集背景】
前列腺癌是泌尿系统常见的恶性肿瘤之一，其中局限性前列腺癌通常指肿瘤仍局限于前列腺腺体内部。对于此类肿瘤，理解其蛋白质组特征有助于从蛋白层面认识肿瘤发生、发展以及与非恶性组织之间的分子差异。该数据集聚焦于局限性前列腺癌的蛋白质组，旨在对局限于腺体的前列腺肿瘤和非恶性前列腺组织进行蛋白质组表征。其主题标签为 Proteomics，说明该资源主要面向蛋白质组学分析。数据集名称中的“part 1”提示其可能是相关研究或数据集合的一个组成部分，但源站未提供关于其他部分的更多说明。
【数据内容】
该数据集包含对前列腺组织样本的蛋白质组表征结果。具体而言，研究从 FFPE 根治性前列腺切除标本中纯化全细胞蛋白提取物，样本包括 28 个肿瘤样本和 8 个邻近非恶性前列腺组织。肿瘤样本对应局限于腺体的前列腺肿瘤，非恶性样本则来自邻近组织，二者可用于比较分析。数据集关联多个 ProteomeXchange 标识：PXD003452、PXD003515、PXD004132、PXD003615、PXD003636 和 PXD004159。这些标识指向蛋白质组学数据在 ProteomeXchange 平台上的收录信息。除上述样本数量、样本类型和标识外，源站未提供关于蛋白鉴定数量、定量方法、表达差异结果或具体蛋白质列表的更多细节。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 omicsdi.org。根据源站描述，样本采集自 FFPE 根治性前列腺切除标本，并从中纯化全细胞蛋白提取物。FFPE 标本是临床病理中常见的保存形式，能够在常规存档条件下保留组织样本，适用于回顾性蛋白质组研究。研究共纳入 28 个肿瘤样本和 8 个邻近非恶性前列腺组织，这些样本均与局限性前列腺癌相关。数据关联的 ProteomeXchange 标识表明其原始蛋白质组数据已提交至该公共平台。除上述信息外，源站未提供关于样本采集时间、患者临床特征、标本处理流程、质谱平台或数据采集参数的进一步说明。
【适用场景】
该数据集适用于局限性前列腺癌蛋白质组学的比较研究，尤其是肿瘤组织与邻近非恶性前列腺组织之间的蛋白质表达差异分析。由于样本来自 FFPE 根治性前列腺切除标本，该资源也可用于探索基于 FFPE 样本的蛋白质组学工作流程。主题标签 Proteomics 表明其可服务于蛋白质组学方法开发、生物标志物发现或肿瘤分子机制研究等方向。此外，关联的多个 ProteomeXchange 标识便于研究者定位和获取原始数据，用于独立分析或与其他前列腺癌蛋白质组数据集进行整合。源站未提供关于具体应用案例或已验证用途的说明。
【使用方法】
使用者可通过 omicsdi.org 获取该数据集的描述信息，并依据关联的 ProteomeXchange 标识访问原始蛋白质组数据。由于数据集涉及肿瘤与非恶性组织的比较，使用时可围绕 28 个肿瘤样本和 8 个邻近非恶性前列腺组织进行分组分析。对于 FFPE 来源的全细胞蛋白提取物数据，使用者需注意样本处理方式可能对蛋白质检测和定量产生影响。源站未提供关于数据格式、下载方式、分析流程或推荐工具的详细说明，因此具体使用方法需结合 ProteomeXchange 平台上的相应记录进一步确认。
【质量与限制】
该数据集的样本数量为 28 个肿瘤样本和 8 个邻近非恶性前列腺组织，样本规模相对有限，可能影响统计功效和结论的普适性。样本来源于 FFPE 根治性前列腺切除标本，FFPE 处理可能对蛋白质完整性、修饰状态和可检测性造成影响，这是使用此类数据时需要关注的技术限制。此外，数据集名称标注为“part 1”，提示其可能并非完整研究数据，但源站未提供关于其他部分或整体研究设计的信息。源站未提供关于数据质量评估、缺失值、批次效应或验证实验的具体说明。
【引用与许可】
该数据集关联的 ProteomeXchange 标识为 PXD003452、PXD003515、PXD004132、PXD003615、PXD003636 和 PXD004159，使用者在使用相关数据时应依据这些标识查找对应的原始记录和引用要求。数据来源站为 omicsdi.org。除上述标识和来源信息外，源站未提供关于许可协议、使用条款、引用格式或数据共享政策的进一步说明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/massive/MSV000080069
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
局限性前列腺肿瘤与非恶性前列腺组织的蛋白质组特征分析。从FFPE根治性前列腺切除标本中纯化全细胞蛋白提取物，共包括28份肿瘤样本和8份邻近非恶性前列腺组织。相关ProteomeXchange标识符：PXD003452、PXD003515、PXD004132、PXD003615、PXD003636、PXD004159。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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