前列腺癌冷冻免疫治疗患者PBMC与前列腺活检的TCR测序
该数据集来自接受冷冻免疫治疗（cryoIT）的前列腺癌患者，共纳入18例，临床试验注册号为NCT02423928。数据包含治疗前后的外周血单个核细胞（PBMC）标本以及冷冻消融时的前列腺活检组织，并对这些样本进行了TCR测序
基本信息
资源简介
前列腺癌冷冻免疫治疗患者PBMC与前列腺活检的TCR测序
该数据集聚焦于接受冷冻免疫治疗（cryoIT）的前列腺癌患者，围绕外周血单个核细胞（PBMC）与前列腺活检组织开展TCR测序研究。数据集共纳入18例前列腺癌患者，相关临床试验已在ClinicalTrials.gov注册，注册号为NCT02423928。样本覆盖治疗前后的PBMC标本以及冷冻消融时的前列腺活检组织，旨在从T细胞受体（TCR）序列层面刻画患者在该治疗模式下的免疫应答特征。数据集归类于肿瘤/前列腺癌方向，主题标签为Genomics，来源站为omicsdi.org。整体而言，该数据集为探索冷冻免疫治疗前后外周免疫与肿瘤局部免疫微环境的动态变化提供了TCR测序层面的资源。
【数据集背景】
前列腺癌是男性常见的恶性肿瘤之一，冷冻免疫治疗（cryoimmunotherapy，cryoIT）是一种将冷冻消融与免疫治疗相结合的策略。该数据集所依托的临床研究在ClinicalTrials.gov注册，标识符为NCT02423928，纳入18例接受cryoIT的前列腺癌患者。数据集关注的核心问题在于：通过TCR测序，观察患者在接受冷冻免疫治疗前后，外周血与前列腺局部组织中T细胞受体库的变化。TCR测序可用于评估T细胞克隆的多样性、扩增与收缩，从而为理解冷冻消融联合免疫治疗所引发的免疫反应提供分子层面的线索。该数据集的主题标签为Genomics，属于肿瘤/前列腺癌分类下的组学数据资源。
【数据内容】
数据集包含对PBMC标本和前列腺活检组织进行的TCR测序数据。具体而言，PBMC标本分别来自cryoIT治疗前和治疗后；前列腺活检组织则采集于冷冻消融（cryoablation）时。数据集纳入了上述两类样本的TCR测序信息，覆盖18例前列腺癌患者。关于采样的具体时间点，源站说明可参见随数据集提供的表格；该表格同时提供访视编号（visit number）和研究周（study week），其中研究周0对应冷冻消融（cryoIT）的时间。除上述内容外，数据集是否包含其他类型的组学数据、临床变量或分析结果，源站未提供。
【采集与来源】
样本来源为接受冷冻免疫治疗的前列腺癌患者，共18例。采集类型包括外周血单个核细胞（PBMC）和前列腺活检组织。PBMC标本在cryoIT治疗前后获取，前列腺活检组织在冷冻消融时获取。临床试验注册号为NCT02423928。数据集来源站为omicsdi.org。关于样本采集的具体操作流程、保存条件、测序平台、测序深度、试剂版本等实验细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于与肿瘤免疫、前列腺癌、冷冻免疫治疗相关的TCR测序研究。潜在应用方向包括：分析cryoIT治疗前后PBMC中T细胞受体库的变化；比较外周血与前列腺局部组织中TCR克隆组成；探索冷冻消融时局部活检组织中的T细胞克隆特征；以及将TCR测序结果与治疗时间点（如研究周0对应的冷冻消融时间）结合，开展纵向免疫应答分析。此外，该数据集也可用于方法学层面的TCR数据分析流程验证或作为同类肿瘤免疫治疗研究的参照资源。具体研究问题是否适用，需结合源站提供的采样时间表与数据实际内容判断。
【使用方法】
使用该数据集时，可依据随数据集提供的表格确定各样本对应的访视编号和研究周，其中研究周0对应冷冻消融（cryoIT）时间，从而区分治疗前、治疗后以及冷冻消融时的样本。PBMC样本可用于分析外周T细胞受体库，前列腺活检样本可用于分析局部组织中的T细胞受体库。由于数据集涉及纵向采样，建议在使用时按患者个体和研究时间点组织数据，以支持治疗前后及外周与局部的比较分析。关于数据的具体格式、文件组织方式、是否提供原始测序读段或已处理克隆表、以及是否需要特定分析软件，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集共纳入18例前列腺癌患者，样本类型包括PBMC和前列腺活检组织，覆盖cryoIT治疗前后及冷冻消融时。源站未提供关于数据质量评估、测序深度、覆盖度、批次效应、缺失值、样本排除标准或质控结果的信息。由于数据集样本量有限，且源站未说明是否包含对照人群或健康对照，使用者在进行统计推断或泛化结论时需谨慎。此外，关于临床结局、治疗响应、随访信息以及患者人口学与临床特征，源站未提供。数据的使用应结合源站提供的采样时间表，并注意研究周0对应冷冻消融时间这一关键定义。
【引用与许可】
该数据集来源站为omicsdi.org，相关临床试验注册号为NCT02423928。关于数据集的引用方式、作者列表、发表文献、数据许可协议、使用条款、是否允许再分发或商业使用等信息，源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集前，应查阅来源站及临床试验注册平台的相关说明，并遵循源站可能规定的数据使用政策。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-10998
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集共包含18名接受冷冻免疫治疗（cryoIT）的前列腺癌患者。该临床试验已在ClinicalTrials.gov注册，标识符为NCT02423928。数据集包括在cryoIT前后获取的PBMC标本以及冷冻消融时的前列腺活检样本。具体的采样时间点可在数据集附带的表格中查阅。为此，提供了访视编号和研究周数，其中研究第0周对应冷冻消融（cryoIT）的时间。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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