在健康和癌症状态下以单细胞水平解析人前列腺免疫图谱

该数据集来自 omicsdi.org,属于肿瘤/前列腺癌方向,主题标签为 Genomics。数据基于单细胞 RNA 测序,对人类前列腺在健康与癌症状态下的细胞图谱进行无偏评估,涵盖肿瘤富集的雄激素受体阴性管腔上皮细胞以及正常前列腺中多种固有和适应性免疫细胞,并发现前列腺特异性锌转运蛋白表达巨噬细胞群

omicsdi
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基因组分类Genomics
Resolving the immune landscape of human prostate at a single cell level  in health and cancer

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

在健康和癌症状态下以单细胞水平解析人前列腺免疫图谱

该数据集聚焦于人类前列腺在健康与癌症状态下的免疫与细胞图谱,基于单细胞 RNA 测序技术展开无偏评估。研究覆盖肿瘤与前列腺癌方向,主题标签为 Genomics,来源为 omicsdi.org。其核心价值在于揭示前列腺这一特殊器官中此前未被充分认识的细胞亚群与免疫细胞组成,尤其是肿瘤富集的雄激素受体阴性管腔上皮细胞,以及正常前列腺中多种固有和适应性免疫细胞在癌症中的转录扰动。此外,该数据集还刻画了一类独特的前列腺特异性锌转运蛋白表达巨噬细胞群(MAC-MT),其在组织锌蓄积的稳态维持中发挥作用,并在炎症相关状态下表现出增强的特征。整体而言,该数据集为理解前列腺癌的免疫微环境与细胞异质性提供了单细胞层面的基础资源。

【数据集背景】

前列腺是产生前列腺液的腺体,其分泌物富含锌和柠檬酸盐,对精子的维持至关重要。前列腺癌是一种常见疾病,尤其在去势抵抗性转移阶段,包括免疫检查点抑制剂在内的治疗手段疗效有限。正是在这一临床与生物学背景下,研究者采用单细胞 RNA 测序技术,对人类前列腺的细胞景观进行无偏评估,以期更深入地理解健康与癌症状态下前列腺的细胞组成与免疫特征。该数据集所属分类为肿瘤 / 前列腺癌,主题标签为 Genomics,来源站为 omicsdi.org。

【数据内容】

该数据集的核心内容围绕人类前列腺在健康与癌症状态下的单细胞转录组图谱展开。研究识别出一个此前未被充分认识的肿瘤富集亚群,即雄激素受体阴性管腔上皮细胞,该亚群表现出癌症相关基因表达的增加。同时,在正常前列腺中发现了多种固有和适应性免疫细胞,这些细胞在前列腺癌中发生了转录层面的扰动。一个例外是一类独特的前列腺特异性锌转运蛋白表达巨噬细胞群(MAC-MT),该群体在稳态下参与组织锌蓄积,并在炎症相关状态下表现出增强的特征。上述内容构成了该数据集在细胞类型、转录状态与免疫景观方面的主要发现。

【采集与来源】

该数据集来源于 omicsdi.org,属于肿瘤 / 前列腺癌方向,主题标签为 Genomics。其数据获取方式为单细胞 RNA 测序,用于对人类前列腺在健康与癌症状态下的细胞图谱进行无偏评估。关于具体的样本采集地点、时间跨度、测序平台型号、试剂批次等细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于前列腺癌免疫微环境与细胞异质性研究,可用于探索肿瘤富集的雄激素受体阴性管腔上皮细胞的特征,分析正常前列腺中固有和适应性免疫细胞在癌症中的转录扰动,以及研究前列腺特异性锌转运蛋白表达巨噬细胞群(MAC-MT)在组织锌蓄积与炎症相关状态中的作用。其主题标签 Genomics 表明其适用于基因组学与单细胞转录组学相关的分析场景。关于具体的临床转化应用、药物靶点筛选或诊断标志物开发等场景,源站未提供。

【使用方法】

该数据集基于单细胞 RNA 测序产生,可用于对健康与癌症状态下的人类前列腺细胞进行无偏评估。使用时可围绕细胞类型鉴定、转录状态比较以及免疫细胞群体分析等方向展开。关于具体的数据格式、预处理流程、分析工具、代码或访问接口等,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来自 omicsdi.org,其描述中提及了单细胞 RNA 测序的无偏评估以及若干细胞群体的发现。关于样本量、测序深度、批次效应、验证实验、统计功效或潜在偏差等质量相关指标,源站未提供。此外,该数据集在临床转化、治疗预测或跨人群适用性方面的限制,源站未提供。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款或版权信息,源站未提供。

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数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAS00001005787

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

前列腺产生的前列腺液富含锌和柠檬酸盐,对维持精子至关重要。前列腺癌是一种常见疾病,在去势抵抗性转移性疾病中治疗效果有限,包括免疫检查点抑制剂。我们使用单细胞RNA测序对人类前列腺的细胞景观进行了无偏评估,并发现了一个先前未被充分认识的肿瘤富集性雄激素受体阴性管腔上皮细胞亚群,其癌症相关基因表达增加。我们还发现正常前列腺中存在多种先天性和适应性免疫细胞,这些细胞在前列腺癌中转录受到扰动。一个例外是独特的、前列腺特异性的、表达锌转运蛋白的巨噬细胞群体(MAC-MT),它在稳态中有助于组织锌积累,但在肿瘤中显示出增强的炎症基因表达,包括T细胞招募趋化因子。值得注意的是,癌症活检中MAC-MT特征的富集与改善的无病生存期相关,表明其具有有益的抗肿瘤功能。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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