胎儿与成体前列腺干细胞的分子特征

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-15580

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数据说明

为明确可能在前列腺癌发生中起作用而异常表达的共有及独特调控因子，我们对成年和胎鼠前列腺干细胞的全局基因表达谱进行了测定。鉴定出胎儿和成年原始前列腺细胞共有的一个独特转录调控因子核心，以及各自群体独有的分子。胎儿和成年前列腺干细胞共有的要素包括Wnt、Shh及其他器官干细胞中已鉴定的通路的表达谱、芳香烃受体的特征，以及醛脱氢酶/视黄酸受体轴组分的上调。还存在一个显著的脂质代谢特征，表现为脂质代谢酶的过表达和Srebp1结合基序的存在。胎儿干细胞群体以更快的增殖和自我更新为特征，高表达细胞周期调控因子，如E2f、Nfy、Tead2和Ap2，而成年干细胞则显示出TGF-β发挥突出作用的特征。

最后，将原始前列腺细胞的标志物特征与先前描述的人类前列腺肿瘤特征进行比较，发现了在前列腺肿瘤中表达失调的干细胞分子和途径，包括染色质修饰因子和癌基因Erg。我们的数据表明，成体前列腺干细胞或祖细胞在肿瘤发生过程中可能获得自我更新的原始胎儿前列腺细胞的特征，并提示前列腺干细胞途径组分的异常激活可能促进前列腺肿瘤的发展。为了识别在原始前列腺群体中活跃的分子和途径，我们确定了四种细胞群体的转录谱：(i) 胎儿泌尿生殖窦上皮细胞，富含胎儿前列腺干细胞，(ii) Sca-1Hi细胞，即表达高水平Sca-1的细胞，富含成体前

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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