TCGA PRAD 前列腺癌病理数据集精炼版(ROI 级标注)

该数据集为 TCGA PRAD 前列腺癌数据集提供增强的 Gleason 分级标注,并配有感兴趣区域(ROI)级别的空间标注,由 Codatta 与 DPath.ai 合作构建病理学家社区完成

huggingface
2024-12-21 更新
浏览 13
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Humanbased-AI/Refined-TCGA-PRAD-Prostate-Cancer-Pathology-Dataset

基本信息

模态
图像
大小
0.01129732 GB
任务类型
图像分割
许可
openrail
创建/更新时间
2024-12-21

资源简介

TCGA PRAD 前列腺癌病理数据集精炼版(ROI 级标注)

Humanbased-AI/Refined-TCGA-PRAD-Prostate-Cancer-Pathology-Dataset

该数据集为 TCGA PRAD 前列腺癌数据集提供增强的 Gleason 分级标注,并配有感兴趣区域(ROI)级别的空间标注,由 Codatta 与 DPath.ai 合作构建病理学家社区完成。数据覆盖 245 例 TCGA 病例,计划分两批上传:首批 138 例,第二批 107 例处于质量审核流程中,预计 2025 年 1 月初上传。数据集包含 CSV 与 geojson 等文件,可用于前列腺癌病理分级研究、ROI 级空间标注分析以及病理图像相关模型训练(来源 Hugging Face,openrail 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2024-12-17。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):> 注意: 我们的 245 例 TCGA 病例是我们认为有改进潜力的病例。我们计划分两批上传:第一批 138 例,第二批 107 例处于质量审核流程中,我们计划在 2025 年 1 月初左右上传。 数据集:对 TCGA PRAD 前列腺数据集标签的第二意见,附 ROI 级标注 概述 该数据集为 TCGA PRAD 前列腺癌数据集提供增强的 Gleason 分级标注,并配有感兴趣区域(ROI)级别的空间标注。该数据集与 Codatta 和 DPath.ai 合作开发,其中 DPath.ai 通过 Codatta 发起了一个专门社区,以汇集病理学家网络,该数据集提高了信息的准确性和粒度

【数据结构与技术规格】

文件数 104 个,合计 21.66 MB。

【主题与分类】

本站分类:肿瘤/前列腺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://huggingface.co/datasets/Humanbased-AI/Refined-TCGA-PRAD-Prostate-Cancer-Pathology-Dataset

使用许可:openrail。

【使用注意】

· 源站最后修改于 2024-12-21,引用时请注意版本时效。

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使用方式

数据集获取与加载(Hugging Face datasets)

# 前置依赖: pip install datasets
from datasets import load_dataset

ds = load_dataset("Humanbased-AI/Refined-TCGA-PRAD-Prostate-Cancer-Pathology-Dataset")
print(ds)  # 查看 splits 与字段结构
# 国内网络可先设镜像: import os; os.environ["HF_ENDPOINT"]="https://hf-mirror.com"
git lfs install && git clone https://hf-mirror.com/datasets/Humanbased-AI/Refined-TCGA-PRAD-Prostate-Cancer-Pathology-Dataset

数据集大小约 11.3 MB。

仓库文件结构

  • .gitattributes
  • README.md
  • cover2.png
  • cover_picture.png
  • workflow_re_annotation.png

数据说明

注:我们的245例TCGA病例是我们认为有改进潜力的病例。我们计划分两批上传:第一批138例,第二批107例正处于质量审查流程中,我们计划在2025年1月初左右上传。数据集:TCGA PRAD前列腺数据集标签的第二意见,附ROI级别注释。概述:该数据集为TCGA PRAD前列腺癌提供了增强的Gleason分级注释……请在数据集页面查看完整描述:https://huggingface.co/datasets/Humanbased-AI/Refined-TCGA-PRAD-Prostate-Cancer-Pathology-Dataset。

完整数据卡:huggingface.co/datasets/Humanbased-AI/Refined-TCGA-PRAD-Prostate-Cancer-Pathology-Dataset

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