尿液细胞外囊泡转录组分析揭示前列腺癌中CDH3的改变

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE75441

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

当前前列腺癌研究面临的挑战之一是改进前列腺癌（PCa）与良性前列腺增生（BPH）的无创鉴别诊断。细胞外囊泡（EV）是新兴的结构，在细胞间通讯方面具有广阔前景。此外，生物体液中EV的表征是无创诊断、预后和预测性生物标志物的一个有吸引力的来源。本研究表明，前列腺癌患者尿液EV（uEV）表现出真实的、差异性的物理和生物学特性。重要的是，uEV的转录组学表征使我们发现，前列腺癌患者uEV中钙黏蛋白3第1型（CDH3）转录本的丰度降低。组织和细胞系分析强烈提示，uEV中CDH3的状态是前列腺肿瘤中该钙黏蛋白表达变化的远端反映。我们的结果揭示，uEV可能成为一种无创工具，用于反映前列腺癌的分子改变。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。