GSE73989:染色质松弛是晚期前列腺癌的特征

GSE73989 是一个关于晚期前列腺癌染色质松弛特征的 SuperSeries 数据集,来源于 NCBI GEO,包含表达谱芯片数据,平台为 GPL10558,物种为人类(9606)

geo
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基因组分类Expression profiling by arrayGPL105589606
GSE73989: Chromatin relaxation is a feature of advanced prostate cancer

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-23

资源简介

GSE73989:染色质松弛是晚期前列腺癌的特征

GSE73989 是一个围绕晚期前列腺癌染色质松弛特征构建的 SuperSeries 数据集,来源于 NCBI GEO,标题为“Chromatin relaxation is a feature of advanced prostate cancer”。该数据集属于肿瘤/前列腺癌分类,包含表达谱芯片数据,平台为 GPL10558,物种为人类(9606)。数据集由 Alfonso、Urbanucci 提交,发布时间为 Oct 14 201。数据集共包含 1 个文件,样例文件为 GSE73989_series_matrix.txt.gz,以 GZIP 压缩格式提供。整体来看,该数据集适合作为研究晚期前列腺癌染色质状态与基因表达关系的表达谱资源使用。

【数据集背景】

该数据集的主题为晚期前列腺癌中的染色质松弛特征,源站标题直接点明了这一研究关注点。数据集被归类于肿瘤/前列腺癌方向,说明其面向的是前列腺癌相关研究场景。作为 SuperSeries,其源站描述指出该数据集由下方列出的若干 SubSeries 组成,即它本身是一个整合性的系列集合,用于汇集相关的子系列数据。该数据集发表于 Oct 14 201,作者为 Alfonso、Urbanucci,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。

【数据内容】

数据集包含表达谱芯片数据,主题标签中给出了 Expression profiling by array、GPL10558 以及 9606。其中 GPL10558 对应芯片平台信息,9606 对应人类物种信息。数据集的文件数量为 1,文件样例为 GSE73989_series_matrix.txt.gz,格式为 GZIP 压缩包。该文件为系列矩阵文件,通常用于承载系列层面的表达谱矩阵信息。源站未提供关于样本数量、分组设计、具体基因或探针数量等更细粒度的内容说明。

【采集与来源】

该数据集来源于 NCBI GEO,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。提交者为 Alfonso、Urbanucci,发布时间为 Oct 14 201。源站描述仅说明该 SuperSeries 由下方列出的 SubSeries 组成,未提供具体的采集方法、实验流程、样本处理或平台操作细节。关于数据采集所采用的具体实验方案与处理步骤,源站未提供。

【适用场景】

基于其主题与数据类型,该数据集可用于晚期前列腺癌染色质松弛相关表达谱研究,例如围绕染色质状态与基因表达谱之间关系的分析探索。其表达谱芯片数据形式适合用于芯片表达数据的读取、整理与后续分析流程的验证。由于该数据集为 SuperSeries,也可作为整合其下属 SubSeries 数据的入口使用。关于具体的分析用途、研究结论或验证结果,源站未提供。

【使用方法】

使用时可下载数据文件 GSE73989_series_matrix.txt.gz,并按文件格式以 GZIP 压缩包方式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入,以保证后续处理的准确性。源站未提供额外的读取脚本、参数设置或分析流程说明。

【质量与限制】

该数据集文件数量为 1,文件样例为系列矩阵文件,源站未提供关于数据完整性、缺失值、批次效应或质控指标的具体信息。由于源站描述仅说明其为由 SubSeries 组成的 SuperSeries,未给出各子系列的详细内容,使用者在解读数据时需注意这一层级结构带来的信息局限。关于数据质量的具体评估结论,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的作者为 Alfonso、Urbanucci,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于该数据集的引用方式与许可条款,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE73989

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.

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