治疗诱导的前列腺癌细胞发育重编程与获得性耐药 [Dataset 2]
该数据集来自 NCBI GEO,标题为治疗诱导的前列腺癌细胞发育重编程与获得性耐药 [Dataset 2],属于肿瘤/前列腺癌方向
![GSE66851: Therapy-Induced Developmental Reprogramming of Prostate Cancer Cells and Acquired Resistance [Dataset 2]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/105119.jpg)
基本信息
资源简介
治疗诱导的前列腺癌细胞发育重编程与获得性耐药 [Dataset 2]
Therapy-Induced Developmental Reprogramming of Prostate Cancer Cells and Acquired Resistance [Dataset 2]
该数据集来自 NCBI GEO,标题为治疗诱导的前列腺癌细胞发育重编程与获得性耐药 [Dataset 2],属于肿瘤/前列腺癌方向。数据基于表达谱芯片平台 GPL6244,物种为人类(9606),共 1 个文件,样例为 GSE66851_series_matrix.txt.gz。研究关注治疗诱导的神经内分泌转分化(NEtD)如何使前列腺癌细胞重编程为神经类癌症干细胞样细胞,并表现出对雄激素信号抑制的耐药及侵袭表型。该数据可用于分析前列腺癌治疗耐药与细胞谱系重编程相关的基因表达变化(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Mar 12 201。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):治疗诱导的神经内分泌转分化(NEtD)使转移性前列腺癌(PCa)的治疗复杂化。基于前列腺癌细胞在体外可转分化为其他神经外胚层来源细胞谱系的证据,我们提出 NEtD 首先需要中间重编程为神经类亚稳态癌症干细胞样细胞(CSCs),并证明几种不同的 AR+/PSA+ PCa 细胞系通过在无雄激素的神经/神经嵴(N/NC)干细胞培养基中生长,被高效重编程为 CSCs,并以此状态维持和扩增。此类重编程细胞失去了前列腺分化特征;获得了 N/NC 干细胞特征和肿瘤起始潜能;对雄激素信号抑制具有耐药性;并在体外和体内获得了侵袭表型。当放回含血清培养基中时,重编程细胞可以再分化
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by array、GPL6244、9606。本站分类:肿瘤/前列腺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE66851
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jul 10 201,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
治疗诱导的神经内分泌转分化(NEtD)使转移性前列腺癌(PCa)的治疗复杂化。基于PCa细胞在体外可转分化为其他神经外胚层来源细胞谱系的证据,我们提出NEtD首先需要重编程为神经类别的亚稳态癌症干细胞样细胞(CSCs)作为中间阶段,并证明几种不同的AR+/PSA+ PCa细胞系通过在无雄激素的神经/神经嵴(N/NC)干细胞培养基中生长,可被高效重编程为CSCs,并维持和增殖。此类重编程细胞失去了前列腺分化特征;获得了N/NC干细胞特征和肿瘤起始潜能;对雄激素信号抑制具有抗性;并在体外和体内获得了侵袭性表型。当被放回含血清的培养基中时,重编程细胞可被重新分化为N-/NC来源的细胞谱系,或恢复为AR+前列腺样状态。一旦恢复,AR+细胞对雄激素信号抑制具有抗性。
在含血清培养基中,急性雄激素剥夺或抗雄激素治疗导致具有相似特征的细胞亚群短暂出现。最后,从重编程的前列腺癌细胞系中获得的132个基因特征能够区分预后不良的前列腺癌患者的肿瘤。该模型可能解释与致死性疾病相关的前列腺癌神经表现。重编程的干细胞样前列腺癌细胞的亚稳态特性表明,前列腺癌细胞重编程随后再分化的循环可能支持疾病进展和治疗耐药。来自重编程前列腺癌细胞的基因特征能够识别具有转移或前列腺癌特异性死亡的患者肿瘤,这意味着发育重编程与侵袭性肿瘤行为相关。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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