原发性前列腺癌干细胞microRNA表达谱：生物标志物与治疗靶点来源

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE59156

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数据说明

本研究从患者来源的良性前列腺增生（BPH，n=5）、Gleason 7 初治前列腺癌（PCa，n=5）和去势抵抗性前列腺癌（CRPC，n=3）中富集前列腺上皮亚群，并据此生成微小RNA（miRNA）表达谱。微阵列表达结果在独立患者队列（n=10）中进行了验证。分析显示，上皮亚群（如干细胞）中的miRNA表达无论病理状态如何均聚类在一起。我们还发现，未分选的CRPC、人胚胎干细胞（SCs）与前列腺上皮SCs（良性和恶性）的miRNA表达谱之间存在一致性。miR-548c-3p被选为该组中的候选miRNA，以探讨其作为CRPC生物标志物和/或治疗靶点的效用。miR-548c-3p的过表达在癌症SCs（8倍，p<0.05）和未分选的CRPC（1.8倍，p<0.05）中得到证实。在分化细胞中强制过表达miR-548c-3p可诱导干细胞样特性（p 0.01）和放射抵抗（p<0.01）。

对已发表研究的再分析进一步显示，miR-548c-3p在CRPC中显著过表达（p<0.05），并与较差的无复发生存期相关（p<0.05），提示miR-548c-3p是前列腺癌侵袭性的功能性生物标志物。我们的结果验证了miRNAs对晚期前列腺癌管理的预后和治疗相关性，同时表明解决细胞类型和分化特异性差异对于获得临床相关的miRNA表达谱至关重要。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。