GSE46738：microRNA 21过表达与根治性前列腺切除术后生化复发相关

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE46738

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数据说明

本研究旨在利用微阵列平台，测定接受根治性前列腺切除术并平均随访47个月的患者前列腺癌组织中的microRNA（miRNA）表达谱。GeneChip® miRNA Array（Affymetrix）包含超过46,000个探针，以及超过1,100种成熟人类miRNA和转录本。表达水平高于或低于1.1且p<0.05被视为差异表达。当比较Gleason评分（GS）<7的肿瘤与GS≥7的肿瘤时，有5种miRNA下调，9种上调。在比较PSA<10 ng/mL患者与PSA≥10 ng/mL患者的肿瘤时，21种miRNA下调，29种过表达。比较pT2与pT3肿瘤时，21种miRNA表达降低，22种表达升高。比较有复发疾病（PSA>0.2 ng/mL）与无复发疾病男性的表达谱显示，14种miRNA下调，17种上调。

综合考虑三个预后因素和生化复发，miR-335在PSA>10 ng/mL患者的pT3肿瘤中过表达，miR-1202在PSA>10 ng/mL的复发性肿瘤中过表达，miR-885和miR-1226在复发性pT3肿瘤中过表达。六种miRNA（miR-361、378、548、574、652和892）在PSA>10 ng/mL患者的pT3肿瘤中表达降低。miR-16在复发性pT3肿瘤中下调。miR-92和miR-450在PSA>10 ng/mL患者的复发性肿瘤中表达降低。miR-28在GS≥7的pT3腺癌中下调。复发性肿瘤中差异表达的miRNA在另外74份标本中通过qRT-PCR进行了验证。miR-21在复发性肿瘤中过表达，在Cox模型中，表达水平高于0.64提示生化复发风险为2.4。这些结果基于接受治疗患者的临床标本

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。