苯磺酸瑞马唑仑对PC-3和SW-480癌细胞系的转录组效应

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE350131

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究探讨了PC-3前列腺癌细胞和SW-480结直肠癌细胞对苯磺酸瑞马唑仑的转录反应。每种细胞系均在未处理对照（NC）、DMSO溶剂对照（VC）和300微摩尔苯磺酸瑞马唑仑处理（T）条件下培养24小时进行研究。DMSO溶剂浓度与处理组匹配，为0.28%。每种细胞系的每个条件均包含三个独立的生物学重复。提取总RNA，并由Novogene使用Illumina NovaSeq 6000平台进行poly(A)富集RNA测序，采用双端150碱基读长。生成了基因水平计数和FPKM值。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。