野生型与前列腺上皮特异性Pten敲除小鼠前列腺组织的单细胞转录组图谱

该数据集来自NCBI GEO,包含野生型小鼠与前列腺上皮特异性Pten条件敲除小鼠前列腺组织的单细胞RNA测序数据,每组三个独立生物学重复

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基因组分类GPL2833010090
GSE348792: Single-cell transcriptomic profiling of prostate tissues from wild-type and prostate epithelial-specific Pten-knockout mice

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-24

资源简介

野生型与前列腺上皮特异性Pten敲除小鼠前列腺组织的单细胞转录组图谱

Single-cell transcriptomic profiling of prostate tissues from wild-type and prostate epithelial-specific Pten-knockout mice

该数据集来自NCBI GEO,包含野生型小鼠与前列腺上皮特异性Pten条件敲除小鼠前列腺组织的单细胞RNA测序数据,每组三个独立生物学重复。数据可用于刻画上皮细胞状态、成纤维细胞胞外基质重塑程序以及前列腺组织微环境的变化,服务于前列腺癌进展中细胞衰老与基质重塑相关研究(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Sep 28 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):细胞衰老和基质重塑是前列腺癌进展的重要特征。为表征与前列腺上皮Pten缺失相关的细胞类型特异性转录变化,我们对野生型小鼠和前列腺上皮特异性Pten条件敲除小鼠的前列腺组织进行了单细胞RNA测序。每组分析了三个独立生物学重复。该数据集用于检查上皮细胞状态、成纤维细胞胞外基质重塑程序以及前列腺组织微环境的变化。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL28330、10090。本站分类:肿瘤/前列腺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE348792

【使用注意】

· 源站最后修改于 Oct 22 202,引用时请注意版本时效。

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

细胞衰老和基质重塑是前列腺癌进展的重要特征。为了表征与前列腺上皮Pten缺失相关的细胞类型特异性转录变化,我们对野生型小鼠和前列腺上皮特异性Pten条件性敲除小鼠的前列腺组织进行了单细胞RNA测序。每组分析了三个独立的生物学重复。该数据集用于检查上皮细胞状态、成纤维细胞细胞外基质重塑程序以及前列腺组织微环境的变化。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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