雄激素刺激快速重塑三维染色质结构及转录因子结合触发前列腺癌AR介导基因转录数据集2

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE333286

标准获取流程：

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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

雄激素受体（AR）介导的转录驱动前列腺癌进展，并始终是关键的治疗靶点。雄激素激活AR后，触发核转位、AR调控元件（AREs）上的DNA结合以及转录起始。该过程涉及FOXA1等共因子、表观遗传修饰及三维染色质相互作用。然而，AR介导转录过程中这些事件的时间协调机制仍知之甚少。我们利用LNCaP前列腺癌细胞中的时间序列雄激素刺激模型，在MOFA+框架内整合时间多组学数据，以解析AR介导的转录动态。分析揭示，AR在基因启动子上的快速结合对于启动AR靶基因的新生转录至关重要。我们鉴定出侧翼AREs处的H3K27乙酰化，该修饰由组成性FOXA1结合预先标记，是AR招募的先决条件。此外，雄激素刺激诱导新生转录从MYC向AR靶基因的时间性早期转移，这很可能由三维染色质相互作用的短暂破坏所介导。

此外，CRISPR介导的对AR相关染色质接触的抑制会沉默相连的靶基因，这表明动态基因组架构是AR驱动转录所必需的。这些发现揭示了雄激素刺激后3D染色质结构和转录因子结合的动态重组，导致形成不同的时间性表观基因组状态。这项工作为前列腺癌中AR介导的转录激活机制提供了新见解，并突出了MYC与AR在调控激素驱动癌症转录中的相互作用。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。