PC3前列腺癌异种移植瘤及配对小鼠血液的Bulk RNA-seq：MS645与JQ1治疗
该数据集为PC3来源的人前列腺癌异种移植瘤及配对小鼠全血的Bulk RNA-seq数据，涵盖vehicle、JQ1（30 mg/kg）和MS645（20 mg/kg）三个治疗组
基本信息
资源简介
PC3前列腺癌异种移植瘤及配对小鼠血液的Bulk RNA-seq：MS645与JQ1治疗
Bulk RNA-seq of PC3-derived human prostate cancer xenografts and matched mouse blood following treatment with the bivalent BET bromodomain inhibitor MS645 or the monovalent inhibitor JQ1
该数据集为PC3来源的人前列腺癌异种移植瘤及配对小鼠全血的Bulk RNA-seq数据，涵盖vehicle、JQ1（30 mg/kg）和MS645（20 mg/kg）三个治疗组。肿瘤reads比对到人参考基因组GRCh38/hg38，血液reads比对到小鼠参考基因组GRCm38/mm10，并用DESeq2分别比较MS645 vs vehicle和JQ1 vs vehicle。研究揭示BRD4-RUVBL1/2轴介导AR阴性前列腺癌对单价BET溴结构域抑制的内在耐药，并表明MS645双价靶向可重编程耐药。可用于研究BET抑制耐药机制及药物响应（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：May 19 202。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：雄性ICR SCID小鼠（5-6周龄）皮下植入5 x 10^6个PC3细胞。当肿瘤达到约200 mm^3时，小鼠被随机分配到三个治疗组之一：vehicle、JQ1（30 mg/kg）或MS645（20 mg/kg）。化合物经腹腔注射给药。研究结束时，处死小鼠，收集配对的异种移植瘤和全血标本并速冻用于bulk RNA-seq。肿瘤RNA-seq reads比对到人参考基因组（GRCh38/hg38），血液RNA-seq reads比对到小鼠参考基因组（GRCm38/mm10）。采用差异表达分析（DESeq2）在各区室中比较MS645 vs vehicle和JQ1 vs vehicle。该研究确定BRD4-RUVBL1/2轴是AR阴性前列腺癌中对单价BET溴结构域抑制的内在耐药性的介导因素，并证明MS645的双价BET靶向可重编程耐药t
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：GPL34281、9606。本站分类：肿瘤/前列腺癌。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE331378
【使用注意】
· 源站最后修改于 Aug 29 202，引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
雄性ICR SCID小鼠（5-6周龄）皮下植入5 x 10^6个PC3细胞。当肿瘤生长至约200 mm^3时，将小鼠随机分配至三个治疗组之一：溶媒对照组、JQ1组（30 mg/kg）或MS645组（20 mg/kg）。化合物经腹腔注射给药。研究结束时，处死小鼠，收集配对的异种移植肿瘤和全血标本，速冻后进行bulk RNA-seq。肿瘤RNA-seq读数比对至人类参考基因组（GRCh38/hg38），血液RNA-seq读数比对至小鼠参考基因组（GRCm38/mm10）。采用差异表达分析（DESeq2）分别在各组织中比较MS645与溶媒对照组以及JQ1与溶媒对照组。该研究确定了BRD4-RUVBL1/2轴是AR阴性前列腺癌中对单价BET溴结构域抑制产生内在耐药的介导因素，并证明MS645的双价BET靶向可将耐药肿瘤重编程为治疗响应性转录状态。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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