前列腺癌生化复发竞争性内源RNA轴预后特征数据集

该数据集来自NCBI GEO,包含前列腺癌患者及恩杂鲁胺耐药LNCaP细胞系的circRNA-miRNA-mRNA转录谱,通过高通量测序对Clone 1(高度耐药)、Clone 9(中度耐药)和Control(恩杂鲁胺敏感)细胞系进行测序以识别耐药相关microRNA,并构建竞争性内源RNA网络模拟

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基因组预测GPL155209606
GSE312115: Competing endogenous RNA axis defines a prognostic signature for biochemical recurrence in prostate cancer

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

前列腺癌生化复发竞争性内源RNA轴预后特征数据集

Competing endogenous RNA axis defines a prognostic signature for biochemical recurrence in prostate cancer

该数据集来自NCBI GEO,包含前列腺癌患者及恩杂鲁胺耐药LNCaP细胞系的circRNA-miRNA-mRNA转录谱,通过高通量测序对Clone 1(高度耐药)、Clone 9(中度耐药)和Control(恩杂鲁胺敏感)细胞系进行测序以识别耐药相关microRNA,并构建竞争性内源RNA网络模拟生化复发。数据可用于研究前列腺癌去势抵抗机制、恩杂鲁胺耐药相关miRNA筛选及生化复发预后特征建模(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Dec 01 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):雄激素剥夺疗法是前列腺癌(PCa)治疗的主要手段,但1/3的患者会进展为去势抵抗性前列腺癌表型。第二代抗雄激素药物如恩杂鲁胺可改善总生存期,然而患者最终会获得耐药性并进展为转移性去势抵抗性前列腺癌。本研究旨在检查PCa患者和恩杂鲁胺耐药LNCaP细胞系的circRNA-miRNA-mRNA转录谱,构建竞争性内源(ceRNA)网络以模拟生化复发。我们对Clone 1(对恩杂鲁胺高度耐药)、Clone 9(对恩杂鲁胺中度耐药)和Control(对恩杂鲁胺敏感)LNCaP细胞系进行了测序,以识别参与耐药的microRNA。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL15520、9606。本站分类:肿瘤/前列腺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE312115

【使用注意】

· 源站最后修改于 Oct 15 202,引用时请注意版本时效。

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

雄激素剥夺疗法是前列腺癌(PCa)治疗的主要手段,然而仍有1/3的患者会进展为去势抵抗性前列腺癌表型。第二代抗雄激素药物如恩杂鲁胺可改善总生存期,但患者最终会产生耐药性,进展为转移性去势抵抗性前列腺癌。本研究旨在检测PCa患者及恩杂鲁胺耐药LNCaP细胞系的circRNA-miRNA-mRNA转录谱,构建竞争性内源RNA(ceRNA)网络以模拟生化复发。我们对Clone 1(对恩杂鲁胺高度耐药)、Clone 9(对恩杂鲁胺中度耐药)和Control(对恩杂鲁胺敏感)LNCaP细胞系进行了测序,以鉴定参与耐药的microRNA。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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