M1期前列腺癌转移灶活检与PBMC单细胞转录组图谱

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE297652

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集包含来自M1期转移性前列腺癌患者的单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据，由两种互补的样本类型组成：来自五名患者的转移病灶活检样本和来自七名患者的外周血单核细胞（PBMCs）。这些数据集共同支持对转移性肿瘤微环境和全身免疫景观的整合分析。处理后的数据包括对数归一化的基因表达矩阵和详细的细胞水平元数据，可用于分析肿瘤-免疫相互作用、循环免疫表型以及与转移性疾病进展相关的分子特征。来自原发肿瘤活检的相关bulk RNA-seq数据集可供使用（参见相关系列：GSE297742），为原发性和转移性疾病状态之间的比较转录组分析提供了机会。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。