前列腺癌各阶段miRNA表达谱及临床意义

该数据集来自NCBI GEO,包含前列腺癌不同阶段及良性前列腺增生(BPH)的miRNA表达谱数据,采用高通量测序技术。数据可用于筛选各阶段差异表达的miRNA,探索其作为疾病进展潜在生物标志物的价值,并支持前列腺癌分子分型与临床相关性研究(来源 NCBI)

geo
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基因组分类GPL203019606
GSE290219: MiRNA Expression Profiling and Clinical Implications in Prostate Cancer Across Various Stages

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-23

资源简介

前列腺癌各阶段miRNA表达谱及临床意义

GSE290219 数据集来自 NCBI GEO,主题为前列腺癌不同阶段及良性前列腺增生中的 miRNA 表达谱与临床意义。该数据集采用高通量测序技术,对前列腺癌不同阶段和良性前列腺增生样本中的 microRNA 表达情况进行检测,旨在筛选并识别各阶段中表现一致的差异表达 miRNA,进而评估其作为疾病进展潜在生物标志物的价值。数据集归类于肿瘤/前列腺癌方向,包含 1 个数据文件,适合用于前列腺癌分子分型、差异表达分析及临床相关性探索等研究场景。

【数据集背景】

前列腺癌是泌尿系统常见的恶性肿瘤,其发生发展涉及多个阶段,不同阶段之间在分子层面可能存在差异。微小 RNA(miRNA)是一类参与基因表达调控的小分子非编码 RNA,在肿瘤发生与进展中具有重要作用。该数据集围绕前列腺癌不同阶段与良性前列腺增生的 miRNA 表达谱展开,研究目标是筛选并识别在不同前列腺癌阶段中表现一致的差异表达 miRNA,以寻找与疾病进展相关的潜在生物标志物。这一背景使数据集具备服务于前列腺癌分期相关分子机制研究与标志物筛选的基础价值。

【数据内容】

数据集包含 1 个文件,文件样例为 GSE290219_series_matrix.txt.gz,属于系列矩阵文件形式,采用 GZIP 压缩。内容为高通量测序获得的 miRNA 表达谱数据,覆盖前列腺癌不同阶段以及良性前列腺增生样本。主题标签包括 Expression profiling by high throughput sequencing、GPL20301 与 9606,分别指向表达谱测序技术、所用平台以及人类物种信息。数据集可用于比较不同阶段样本间 miRNA 的表达差异,并支持围绕疾病进展开展分子分型与临床相关性分析。

【采集与来源】

数据来源于 NCBI GEO(ncbi.nlm.nih.gov),源站标题为“MiRNA Expression Profiling and Clinical Implications in Prostate Cancer Across Various Stages”。作者为 Zhengjie,XIANG,发布时间为 Feb 21 202。样本采集的具体地点、时间跨度、样本量及临床随访信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于前列腺癌不同阶段与良性前列腺增生之间 miRNA 差异表达的比较研究,可用于筛选在各阶段表现一致的候选 miRNA,并探索其作为疾病进展潜在生物标志物的可能性。同时可支持前列腺癌分子分型研究以及与临床特征相关的相关性分析。对于方法学层面,也可作为高通量测序表达谱数据处理与分析的练习数据。具体临床终点与验证性应用,源站未提供。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件 GSE290219_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩格式读取。建议先在小样本上核对字段结构与编码方式,确认无误后再进行批量接入与后续分析。分析内容可围绕不同阶段样本间的表达差异比较展开,并结合样本分组信息进行分组统计。由于源站未提供更详细的预处理与标准化说明,具体分析流程需依据数据文件实际内容确定。

【质量与限制】

数据集仅包含 1 个文件,样本规模、测序深度、批次信息及质控指标等均未在源站描述中给出,源站未提供相关质量评估结论。数据覆盖前列腺癌不同阶段与良性前列腺增生,但各阶段的具体样本构成与临床注释完整程度源站未提供。使用时应关注表达谱数据的标准化处理与批次效应,相关限制信息需以源站记录为准。

【引用与许可】

数据集作者为 Zhengjie,XIANG,来源为 NCBI GEO。数据的使用许可、引用规范及授权条款,源站未提供,使用前应查阅源站相应记录予以确认。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE290219

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究旨在利用高通量测序技术,筛选并鉴定前列腺癌(PCa)不同阶段及良性前列腺增生(BPH)中的microRNA(miRNA)表达谱。研究试图确定特定miRNA是否在PCa各阶段表现出一致的差异表达,以期识别与疾病进展相关的潜在生物标志物。

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