GSE277727：PROX1 是前列腺癌 AR 通路缺失与谱系可塑性的早期驱动因子

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE277727

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数据说明

前列腺癌中的谱系可塑性现已被认为是致死性的关键决定因素。它代表一个连续谱，从AR活性低的肿瘤到不表达神经内分泌前列腺癌（NEPC）程序的AR缺失肿瘤——称为双阴性前列腺癌（DNPC）——以及完全AR缺失的NEPC肿瘤。尽管其重要性，谱系可塑性过程中早期上调的因素尚未被确定。识别这些因素对于检测正在经历谱系可塑性或有发展风险的肿瘤至关重要。通过对转移性去势抵抗性前列腺癌患者肿瘤、患者来源的异种移植和细胞模型进行整合基因组分析，我们发现PROX1在谱系可塑性连续谱中早期上调，特别是在AR活性低的肿瘤中，并在DNPC和NEPC肿瘤中逐渐增加。我们的功能研究表明，PROX1在NEPC中发挥关键作用，因为使用慢病毒shRNA敲低（KD）它可减少神经内分泌表型，降低细胞增殖，并增加细胞凋亡。

在本数据集中，我们提供了NEPC细胞（NCI-H660）中PROX1敲低后的RNA-seq数据，揭示了PROX1抑制所改变的关键通路。这些发现表明，PROX1是NEPC治疗中一个有前景的靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。