转移性激素初治前列腺癌原发肿瘤活检转录分析揭示SOX11在前列腺癌细胞播散中的重要作用[DU145-SOX11过表达数据集]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE268408

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

转移性激素初治前列腺癌（mHNPC）是这类肿瘤中一种少见的类型，其特征为诊断时即存在转移，占前列腺癌相关死亡的50%。尽管局限性和转移性去势抵抗性前列腺癌（mCRPC）已被广泛表征，但mHNPC的分子特征在很大程度上仍未被探索。为了表征mHNPC的转录组景观，我们生成了发现和验证批量和单细胞RNA-Seq数据集。我们结合实验研究进行了整合计算分析。我们的结果提供了前所未有的证据，表明mHNPC具有独特的转录谱，并确定基质重塑是这些肿瘤的一个主要特征。重要的是，我们发现转录因子SOX11在触发与获得转移特性相关的异型通讯中发挥核心作用。我们的研究将为深入理解mHNPC提供宝贵的资源，并可能影响患者管理。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。