转移性激素初治前列腺癌原发肿瘤活检转录分析:SOX11在前列腺癌细胞播散中的作用(发现数据集)

该数据集为转移性激素初治前列腺癌(mHNPC)的发现阶段转录组数据,包含bulk与单细胞RNA-Seq,用于刻画mHNPC的转录景观

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基因组分类GPL246769606
基因组GSE268308: Transcriptional analysis of metastatic hormone-naïve prostate cancer primary tumour biopsies reveals a relevant role for SOX11 in prostate cancer cell dissemination [Discovery dataset]

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

转移性激素初治前列腺癌原发肿瘤活检转录分析:SOX11在前列腺癌细胞播散中的作用(发现数据集)

Transcriptional analysis of metastatic hormone-naïve prostate cancer primary tumour biopsies reveals a relevant role for SOX11 in prostate cancer cell dissemination [Discovery dataset]

该数据集为转移性激素初治前列腺癌(mHNPC)的发现阶段转录组数据,包含bulk与单细胞RNA-Seq,用于刻画mHNPC的转录景观。mHNPC在诊断时即伴转移,约占前列腺癌相关死亡的50%,但其分子特征仍待阐明。数据整合计算分析与实验研究,揭示mHNPC独特的转录谱,并将基质重塑识别为主要特征,同时发现转录因子SOX11在触发异型细胞通讯中的核心作用。可用于探索mHNPC的分子机制、SOX11功能及肿瘤微环境互作(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:May 24 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):转移性激素初治前列腺癌(mHNPC)是这种肿瘤类型中一种不常见的形式,其特征是诊断时即存在转移,占前列腺癌相关死亡的50%。尽管对局限性前列腺癌和转移性去势抵抗性前列腺癌(mCRPC)已有广泛表征,但mHNPC的分子特征在很大程度上仍未被探索。为了表征mHNPC的转录组景观,我们生成了发现和验证批量的以及单细胞的RNA-Seq数据集。我们进行了整合计算分析并结合实验研究。我们的结果提供了前所未有的证据,表明mHNPC具有独特的转录谱,并确定基质重塑是这些肿瘤的主要特征。重要的是,我们发现转录因子SOX11在触发一种异型通讯中起核心作用,该通讯

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24676、9606。本站分类:肿瘤/前列腺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE268308

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jun 24 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

转移性激素初治前列腺癌(mHNPC)是这类肿瘤中一种较少见的类型,其特征为诊断时即存在转移,占前列腺癌相关死亡的50%。尽管局限性和转移性去势抵抗性前列腺癌(mCRPC)已被广泛表征,但mHNPC的分子特征在很大程度上仍未被探索。为了表征mHNPC的转录组景观,我们生成了发现和验证批量和单细胞RNA-Seq数据集。我们结合实验研究进行了整合计算分析。我们的结果提供了前所未有的证据,表明mHNPC具有独特的转录谱,并确定基质重塑是这些肿瘤的一个主要特征。重要的是,我们发现转录因子SOX11在触发与获得转移特性相关的异型通讯中发挥核心作用。我们的研究将为深入理解mHNPC提供宝贵的资源,并可能影响患者管理。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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