去势抵抗性前列腺癌基因表达特征

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE262940

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

前列腺是一个高度依赖雄激素的腺体。因此，转移性前列腺癌的一线治疗是雄激素消融。这可以通过多种非手术方法实现。然而，大多数此类癌症虽然初期反应良好，但迟早会对雄激素消融产生耐药性。这些癌症随后变得极具侵袭性且难以治疗，从而严重影响患者预后。去势抵抗性前列腺癌的基因表达特征将有助于识别导致去势抵抗的机制，并预测癌症向去势抵抗的进展。为此，我们课题组进行了RNA-seq分析：a. 对照组（C）；b. 去势敏感组（B）；c. 去势抵抗组（A）。使用RNA-seq对这些样本进行了基因表达谱分析。鉴定了对照组与去势敏感组之间以及对照组与去势抵抗组之间的差异表达基因。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。