GSE249750:N6-甲基腺苷RNA修饰与前列腺癌恩杂鲁胺耐药相关

该数据集来自NCBI GEO,标题为N6-甲基腺苷RNA修饰与前列腺癌恩杂鲁胺耐药相关,属于肿瘤/前列腺癌分类。可用于研究m6A RNA修饰在前列腺癌恩杂鲁胺耐药中的表达特征,支持耐药相关预测分析(来源 NCBI)

geo
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基因组预测GPL246769606
GSE249750: N6-methyladenosine RNA modification is associated with enzalutamide resistance in prostate cancer

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

GSE249750:N6-甲基腺苷RNA修饰与前列腺癌恩杂鲁胺耐药相关

GSE249750 是一个来自 NCBI GEO 的公开数据集,标题为“N6-methyladenosine RNA modification is associated with enzalutamide resistance in prostate cancer”,即 N6-甲基腺苷(m6A)RNA 修饰与前列腺癌恩杂鲁胺耐药相关。该数据集在本站归入肿瘤 / 前列腺癌分类,主题涉及高通量测序表达谱分析,物种为人类(9606),平台编号为 GPL24676。数据集由 Emmanuelle、Hodara 提交,发布时间为 2024 年 12 月 8 日,共包含 1 个文件,样例文件为 GSE249750_series_matrix.txt.gz。整体而言,该数据集可用于考察 m6A RNA 修饰在前列腺癌恩杂鲁胺耐药中的表达特征,并支持耐药相关的预测分析。

【数据集背景】

前列腺癌是常见的男性恶性肿瘤之一,恩杂鲁胺等雄激素受体通路抑制剂在临床治疗中占有重要地位,而耐药的出现往往限制其疗效。N6-甲基腺苷(m6A)是 RNA 上一种重要的转录后修饰,参与 RNA 的加工、稳定性与翻译等过程。该数据集以“N6-甲基腺苷 RNA 修饰与前列腺癌恩杂鲁胺耐药相关”为主题,围绕这一生物学问题组织高通量测序表达谱数据,为研究 m6A 修饰与恩杂鲁胺耐药之间的关系提供数据基础。

【数据内容】

该数据集属于高通量测序表达谱(Expression profiling by high throughput sequencing)类型,物种为人类(9606),关联平台为 GPL24676。数据集共包含 1 个文件,样例文件名为 GSE249750_series_matrix.txt.gz,采用 GZIP 压缩格式,属于 series matrix 类型的汇总文件。源站描述指出,该 SuperSeries 由下方列出的若干 SubSeries 组成,说明其数据组织上包含子系列结构。除上述信息外,样本数量、分组设计、具体基因或位点信息等细节源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 NCBI GEO(ncbi.nlm.nih.gov),由 Emmanuelle、Hodara 提交,发布时间为 2024 年 12 月 8 日。数据通过高通量测序方式产生表达谱信息,平台编号为 GPL24676。关于样本的具体采集地点、处理流程、测序深度与实验批次等信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于研究 m6A RNA 修饰在前列腺癌恩杂鲁胺耐药中的表达特征,可支持耐药相关预测分析。研究者可基于其表达谱信息探索耐药与敏感状态下的修饰或表达差异,也可将其作为前列腺癌耐药机制研究的公共数据资源,用于方法验证或与其他数据集进行对照分析。具体分析方向应结合数据实际内容确定。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件 GSE249750_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入,以保证后续分析的一致性与准确性。由于该数据集为 SuperSeries 结构,使用前宜确认其子系列组成,以便正确理解数据层次。

【质量与限制】

该数据集仅提供 1 个汇总文件,样本层面的原始信息与详细实验条件源站未提供,可能限制对数据质量的独立评估。此外,源站描述较为简略,未给出样本量、重复数及统计功效等信息。使用时应注意数据规模与来源的局限性,结合研究目的谨慎解读结果。

【引用与许可】

该数据集来自 NCBI GEO,提交者为 Emmanuelle、Hodara。关于具体的引用方式与使用许可条款,源站未提供,使用前应查阅源站页面获取相应说明。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE249750

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.

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