GSE244267：不同间充质细胞状态介导前列腺癌进展（人）

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE244267

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们旨在确定肿瘤基质中的分子改变是否影响前列腺癌的进展和转移潜能。为实现这一目标，我们通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）比较了四种代表不同疾病阶段的基因工程小鼠模型（GEMMs）中的间充质细胞与其野生型（WT）对应细胞，并最终与具有可比基因型的人类肿瘤进行比较。我们鉴定出8个在转录和功能上各异的基质细胞群体，它们负责共同的以及GEMM特异性的转录程序。这些群体在小鼠模型与具有相同基因组驱动因素的人类前列腺癌之间是保守的。晚期疾病小鼠模型的基质转录谱与人类前列腺癌骨转移的转录谱相似，其中基质细胞表达的骨膜蛋白影响侵袭和神经内分泌分化。随后，我们利用这些转录谱构建了一个稳健的基因特征，该特征能够独立于Gleason评分预测局限性疾病的转移进展。

综上所述，这提供了新的证据，表明基质微环境介导了前列腺癌的进展。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。