SIX2通过Wnt/β-catenin信号通路促进雄激素受体非依赖性前列腺癌细胞可塑性（ChIP-seq）

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE235956

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

雄激素受体（AR）抑制剂在前列腺癌中的应用会导致细胞谱系可塑性增加，从而对AR靶向治疗产生耐药性。通过检测AR阳性前列腺癌细胞在暴露于AR抑制剂恩杂鲁胺后的染色质景观，我们鉴定出一个新的细胞可塑性调控因子——同源盒转录因子SIX2，其基序在治疗后开放区域中富集。我们的研究表明，在雄激素非依赖性PC-3前列腺癌细胞中敲低SIX2足以诱导细胞从干细胞样状态向上皮状态转变，从而在体外和体内减少增殖、集落形成和转移等关键癌症相关特性。这些效应是通过下调Wnt/β-catenin信号通路以及随后减少β-catenin的核定位所介导的。总之，我们的发现提供了有力证据，表明敲低SIX2可能是克服驱动前列腺癌AR耐药的细胞可塑性机制的一种有前景的策略。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。