FTO基因座lncRNA抑制mRNA m6A甲基化与p53抑癌功能数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE212043

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

FTO基因位点通过编码N6-甲基腺苷（m6A）去甲基化酶FTO或遗传性基因组变异（如内含子单核苷酸多态性）与癌症和肥胖相关联。本研究表明，FTO-IT1——一种由FTO基因内含子转录而来的长非编码RNA（lncRNA）——在前列腺癌（PCa）进展过程中表达上调，并且仅在表达野生型p53的肿瘤患者中与不良生存率呈正相关。我们发现，RBM15作为m6A甲基转移酶复合物的mRNA/底物结合亚基，能够结合并增强p53转录靶基因mRNA的m6A甲基化及稳定性；然而，FTO-IT1的过表达通过阻断RBM15与p53靶基因mRNA的结合而消除了这些效应。靶向FTO-IT1的治疗可恢复mRNA m6A水平及p53信号传导，并抑制小鼠前列腺癌肿瘤生长。本研究确认FTO-IT1 lncRNA是m6A甲基化和p53肿瘤抑制作用的真正抑制剂，并提名FTO-IT1作为癌症的潜在生物标志物和治疗靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。