前列腺癌中FANCI对Fanconi贫血通路的调控

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE211363

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数据说明

前列腺癌是全球男性主要死因之一，因此研究促使治疗耐药癌细胞形成的遗传因素对于改善患者预后至关重要。在此，我们报道了前列腺癌中对FANCI及相关信号通路的一种细胞系特异性依赖，用以对抗DNA损伤性化疗的影响。我们的结果揭示，FANCI耗竭导致前列腺癌细胞中范可尼贫血（FA）通路成员显著下调，表明FANCI是FA通路的重要调控因子。此外，我们发现FANCI沉默可降低表达p53的前列腺癌细胞的增殖。这进一步提供了证据，表明在DNA损伤性化疗的应激下，FANCI失活可能使癌细胞从耐药状态转变为可根除状态。我们的结果还表明，FA通路基因的高表达与前列腺癌患者较差的生存率相关。

此外，FA通路成员的基因组改变在前列腺腺癌患者中普遍存在；七个患者队列（总共N=1732个肿瘤样本）中FA通路基因的突变和拷贝数信息显示，1025个（59.2%）肿瘤样本在至少一个FA通路基因中存在改变，这表明该通路的基因组改变是该疾病患者的一个显著特征。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。