APPL1/2蛋白调控人PC-3U细胞基因表达的全基因组分析

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE206243

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

转化生长因子β（TGFβ）在多种晚期癌症中过表达，并促进肿瘤进展。癌细胞如何逃避TGFβ诱导的生长抑制并脱离正常稳态，目前尚不清楚。在此，我们报道TGFβ I型受体（TβRI）与内体衔接蛋白APPL1和APPL2共同促进survivin和Aurora激酶B（AURKB）的表达。我们显示，在PC-3U前列腺癌细胞和KELLY神经母细胞瘤细胞的末期，TβRI的胞内部分与AURKB结合。TβRI/肿瘤坏死因子受体相关因子6（TRAF6）复合物通过引起TRAF6诱导的AURKB在Lys85和Lys87位点的Lys63连接多聚泛素化来激活AURKB，从而促进癌细胞分裂和存活。该机制可能有助于TGFβ在晚期癌症中的促肿瘤发生效应。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。