过表达ETV1的RWPE1细胞转录组分析

该数据集为GSE188248,标题为过表达ETV1的RWPE1细胞转录组分析,属于肿瘤/前列腺癌分类,来源为NCBI。主题标签涉及高通量测序表达谱分析、平台GPL18573和物种9606

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基因组分类GPL185739606
GSE188248: Transcriptome analysis of RWPE1 cells Overexpressing ETV1

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-08

资源简介

过表达ETV1的RWPE1细胞转录组分析

GSE188248 是一个聚焦肿瘤/前列腺癌方向的转录组数据集,英文标题为“Transcriptome analysis of RWPE1 cells Overexpressing ETV1”,即对过表达 ETV1 的 RWPE1 细胞进行转录组分析。该数据集来源于 NCBI(ncbi.nlm.nih.gov),由 Carlos、Lopez Garcia 提交,发布时间为 Nov 05 202。数据集以高通量测序表达谱分析为主题,涉及平台 GPL18573 与物种编号 9606,共包含 1 个文件,样例文件为 GSE188248_series_matrix.txt.gz。整体而言,该数据集围绕 ETV1 过表达这一实验条件,提供 RWPE1 细胞的表达谱数据,可供前列腺癌相关转录组研究参考使用。

【数据集背景】

该数据集的主题为过表达 ETV1 的 RWPE1 细胞转录组分析,归入肿瘤 / 前列腺癌分类。源站标题与数据集英文名一致,均指向 RWPE1 细胞在 ETV1 过表达条件下的转录组层面分析。ETV1 过表达与 RWPE1 细胞相结合,构成该数据集的核心实验背景。源站描述指出,该 SuperSeries 由下方列出的 SubSeries 组成,说明其在组织上属于一个汇总性质的数据集条目。数据集的作者为 Carlos、Lopez Garcia,发布时间为 Nov 05 202。

【数据内容】

该数据集共包含 1 个文件,文件样例为 GSE188248_series_matrix.txt.gz,属于 GZIP 压缩格式。主题标签涵盖 Expression profiling by high throughput sequencing、GPL18573 与 9606,表明数据属于高通量测序表达谱类型,关联平台 GPL18573,物种为 9606。除上述文件与标签信息外,源站未提供更细化的样本数量、分组设计或矩阵字段说明。

【采集与来源】

数据集来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,源站标题为“Transcriptome analysis of RWPE1 cells Overexpressing ETV1”。源站描述仅说明该 SuperSeries 由下方列出的 SubSeries 组成。关于具体的采集方法、测序策略与实验流程,源站未提供。

【适用场景】

依据其主题与分类,该数据集可用于肿瘤 / 前列腺癌方向中围绕 ETV1 过表达与 RWPE1 细胞的转录组表达谱分析场景,例如作为高通量测序表达谱数据的参考来源。具体的研究用途与结论性应用,源站未提供。

【使用方法】

使用时可下载数据文件 GSE188248_series_matrix.txt.gz,并按文件格式以 GZIP 压缩包方式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入。除此之外的处理流程与参数设置,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集仅含 1 个文件,源站描述较为简略,仅说明 SuperSeries 由 SubSeries 组成。关于数据质量评估、批次信息、样本量及潜在偏差等,源站未提供。

【引用与许可】

数据集的作者为 Carlos、Lopez Garcia,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于具体的引用格式与许可条款,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE188248

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.

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