过表达ETV1的RWPE1细胞转录组分析
该数据集为GSE188248,标题为过表达ETV1的RWPE1细胞转录组分析,属于肿瘤/前列腺癌分类,来源为NCBI。主题标签涉及高通量测序表达谱分析、平台GPL18573和物种9606

基本信息
资源简介
过表达ETV1的RWPE1细胞转录组分析
GSE188248 是一个聚焦肿瘤/前列腺癌方向的转录组数据集,英文标题为“Transcriptome analysis of RWPE1 cells Overexpressing ETV1”,即对过表达 ETV1 的 RWPE1 细胞进行转录组分析。该数据集来源于 NCBI(ncbi.nlm.nih.gov),由 Carlos、Lopez Garcia 提交,发布时间为 Nov 05 202。数据集以高通量测序表达谱分析为主题,涉及平台 GPL18573 与物种编号 9606,共包含 1 个文件,样例文件为 GSE188248_series_matrix.txt.gz。整体而言,该数据集围绕 ETV1 过表达这一实验条件,提供 RWPE1 细胞的表达谱数据,可供前列腺癌相关转录组研究参考使用。
【数据集背景】
该数据集的主题为过表达 ETV1 的 RWPE1 细胞转录组分析,归入肿瘤 / 前列腺癌分类。源站标题与数据集英文名一致,均指向 RWPE1 细胞在 ETV1 过表达条件下的转录组层面分析。ETV1 过表达与 RWPE1 细胞相结合,构成该数据集的核心实验背景。源站描述指出,该 SuperSeries 由下方列出的 SubSeries 组成,说明其在组织上属于一个汇总性质的数据集条目。数据集的作者为 Carlos、Lopez Garcia,发布时间为 Nov 05 202。
【数据内容】
该数据集共包含 1 个文件,文件样例为 GSE188248_series_matrix.txt.gz,属于 GZIP 压缩格式。主题标签涵盖 Expression profiling by high throughput sequencing、GPL18573 与 9606,表明数据属于高通量测序表达谱类型,关联平台 GPL18573,物种为 9606。除上述文件与标签信息外,源站未提供更细化的样本数量、分组设计或矩阵字段说明。
【采集与来源】
数据集来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,源站标题为“Transcriptome analysis of RWPE1 cells Overexpressing ETV1”。源站描述仅说明该 SuperSeries 由下方列出的 SubSeries 组成。关于具体的采集方法、测序策略与实验流程,源站未提供。
【适用场景】
依据其主题与分类,该数据集可用于肿瘤 / 前列腺癌方向中围绕 ETV1 过表达与 RWPE1 细胞的转录组表达谱分析场景,例如作为高通量测序表达谱数据的参考来源。具体的研究用途与结论性应用,源站未提供。
【使用方法】
使用时可下载数据文件 GSE188248_series_matrix.txt.gz,并按文件格式以 GZIP 压缩包方式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入。除此之外的处理流程与参数设置,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集仅含 1 个文件,源站描述较为简略,仅说明 SuperSeries 由 SubSeries 组成。关于数据质量评估、批次信息、样本量及潜在偏差等,源站未提供。
【引用与许可】
数据集的作者为 Carlos、Lopez Garcia,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于具体的引用格式与许可条款,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE188248
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




