Hsa-miR-1-2/miR-133a-1簇DNA高甲基化沉默触发前列腺癌侵袭相关癌基因
该数据集来自NCBI GEO(GSE181350),聚焦前列腺癌中Hsa-miR-1-2/miR-133a-1簇因DNA高甲基化而表达沉默、进而触发癌基因并促进肿瘤侵袭性的机制

基本信息
资源简介
Hsa-miR-1-2/miR-133a-1簇DNA高甲基化沉默触发前列腺癌侵袭相关癌基因
Hsa-miR-1-2/miR-133a-1 cluster expression silencing by DNA hypermethylation triggers oncogenes contributing to prostate cancer aggressiveness
该数据集来自NCBI GEO(GSE181350),聚焦前列腺癌中Hsa-miR-1-2/miR-133a-1簇因DNA高甲基化而表达沉默、进而触发癌基因并促进肿瘤侵袭性的机制。数据基于非编码RNA芯片平台(GPL21572),包含1个系列矩阵文件,样本涉及高脂饮食诱导的代谢综合征样C57BL/6J小鼠模型及TRAMP-C1前列腺癌细胞接种。可用于分析癌症相关miRNA表达变化,探索DNA甲基化调控miRNA与前列腺癌进展的关系(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Aug 02 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):我们建立了一个代谢综合征(MeS)样疾病模型,使用长期喂食高脂饮食(HFD)的C57BL/6J小鼠,并接种TRAMP-C1前列腺癌(PCa)细胞,以研究HFD对癌症相关miRNA表达的影响。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Non-coding RNA profiling by array、GPL21572、10090。本站分类:肿瘤/前列腺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE181350
【使用注意】
· 源站最后修改于 Nov 18 202,引用时请注意版本时效。
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
我们利用长期喂食高脂饮食(HFD)并接种TRAMP-C1前列腺癌(PCa)细胞的C57BL/6J小鼠,建立了一个代谢综合征(MeS)样疾病模型,以研究HFD对癌症相关miRNA表达的影响。在本数据集中,我们纳入了从对照饮食(CD)与高脂饮食(HFD)C57BL/6J雄性小鼠中形成的TRAMP-C1肿瘤所获得的表达数据。对于差异表达分析,我们采用了针对两类非配对数据的秩积法(Rank Product Method),并将错误发现率(FDR)设定为 < 0.05。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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