GSE179743：前列腺癌中BAZ2A-RNA依赖的与TOP2A和KDM1A关联抑制基因表达

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE179743

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数据说明

BAZ2A抑制由RNA聚合酶I转录的rRNA基因（rDNA）。在前列腺癌（PCa）中，BAZ2A的功能超出了这一作用，因为它还抑制在转移性疾病中经常被沉默的基因。然而，BAZ2A介导的这种抑制机制仍不清楚。在此，我们表明BAZ2A通过其RNA结合TAM结构域抑制基因，其机制与rDNA沉默不同。尽管TAM结构域介导BAZ2A募集至rDNA，但在PCa中，这并非BAZ2A与靶基因结合所必需。相反，BAZ2A-TAM结构域与RNA结合，介导与拓扑异构酶2A（TOP2A）和组蛋白去甲基化酶KDM1A的相互作用，而这两种酶的表达在局限性和转移性PCa中与BAZ2A水平呈正相关。药理学抑制TOP2A和KDM1A会上调受BAZ2A抑制的基因，这些基因由BAZ2A结合的失活增强子调控，而rRNA基因不受影响。我们的发现揭示了PCa中一种基于RNA的新型基因调控机制。

此外，我们确定BAZ2A与TOP2A及KDM1A之间的RNA介导相互作用抑制了对前列腺癌至关重要的基因，并可能有助于对患者的前列腺癌风险和治疗进行分层。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。