GSE147250:TP53与RB1联合缺失促进前列腺癌对广谱抗癌治疗耐药并赋予复制应激易感性

源站描述基于410例转移性活检的深度基因组分析,研究TP53与RB1联合缺失与前列腺癌表型的关系,发现40%的TP53/RB1缺陷肿瘤仍为AR活性腺癌,且TP53/RB1缺失表达特征与AR拮抗剂反应减弱和生存期缩短相关

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基因组分类GPL167919606
GSE147250: Combined TP53 and RB1 Loss Promotes Prostate Cancer Resistance to a Broad Spectrum of Cancer Therapeutics and Confers Vulnerability to Replication Stress

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-23

资源简介

GSE147250:TP53与RB1联合缺失促进前列腺癌对广谱抗癌治疗耐药并赋予复制应激易感性

Combined TP53 and RB1 Loss Promotes Prostate Cancer Resistance to a Broad Spectrum of Cancer Therapeutics and Confers Vulnerability to Replication Stress

该数据集来自NCBI GEO,包含1个文件(GSE147250_series_matrix.txt.gz),主题为高通量测序表达谱分析,物种为人(9606),平台为GPL16791。源站描述基于410例转移性活检的深度基因组分析,研究TP53与RB1联合缺失与前列腺癌表型的关系,发现40%的TP53/RB1缺陷肿瘤仍为AR活性腺癌,且TP53/RB1缺失表达特征与AR拮抗剂反应减弱和生存期缩短相关。数据可用于前列腺癌耐药与神经内分泌分化相关表达特征的分析(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Mar 20 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):携带强效抑癌基因TP53和RB1缺失的前列腺癌(PC)预后不良,包括对雄激素受体(AR)通路拮抗剂耐药。TP53和RB1还影响细胞可塑性,并且常在伴有神经内分泌(NE)分化的PC中缺失。针对这些侵袭性变异型PC的治疗策略亟需开发。利用对410例转移性活检的深度基因组分析,我们确定了TP53和RB1联合缺失与PC表型之间的关系。值得注意的是,40%的TP53/RB1缺陷肿瘤被归类为AR活性腺癌,表明NE分化并非TP53/RB1失活的必然结果。反映TP53/RB1缺失的基因表达特征与AR拮抗剂反应减弱和生存期缩短相关。这些肿瘤表现出高增殖率以及 elevated 的证据

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL16791、9606。本站分类:肿瘤/前列腺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE147250

【使用注意】

· 源站最后修改于 Feb 05 202,引用时请注意版本时效。

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE147250

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

丧失强效肿瘤抑制因子TP53和RB1的前列腺癌(PC)预后不良,包括对雄激素受体(AR)通路拮抗剂耐药。TP53和RB1还影响细胞可塑性,并且在具有神经内分泌(NE)分化的前列腺癌中经常缺失。亟需针对这些侵袭性变异型前列腺癌的治疗策略。通过对410例转移性活检进行深度基因组分析,我们确定了TP53和RB1联合缺失与前列腺癌表型之间的关系。值得注意的是,40%的TP53/RB1缺陷肿瘤被归类为AR活性腺癌,表明NE分化并非TP53/RB1失活的必然结果。反映TP53/RB1缺失的基因表达特征与对AR拮抗剂反应减弱和生存期缩短相关。这些肿瘤表现出高增殖率以及DNA修复过程增强的证据。虽然缺乏TP53/RB1的肿瘤细胞对所有单药治疗均高度耐药,但药理学PARP和ATR抑制的联合产生了显著反应,反映出由复制应激产生的临床可利用的脆弱性。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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