GSE147250:TP53与RB1联合缺失促进前列腺癌对广谱抗癌治疗耐药并赋予复制应激易感性
源站描述基于410例转移性活检的深度基因组分析,研究TP53与RB1联合缺失与前列腺癌表型的关系,发现40%的TP53/RB1缺陷肿瘤仍为AR活性腺癌,且TP53/RB1缺失表达特征与AR拮抗剂反应减弱和生存期缩短相关

基本信息
资源简介
GSE147250:TP53与RB1联合缺失促进前列腺癌对广谱抗癌治疗耐药并赋予复制应激易感性
Combined TP53 and RB1 Loss Promotes Prostate Cancer Resistance to a Broad Spectrum of Cancer Therapeutics and Confers Vulnerability to Replication Stress
该数据集来自NCBI GEO,包含1个文件(GSE147250_series_matrix.txt.gz),主题为高通量测序表达谱分析,物种为人(9606),平台为GPL16791。源站描述基于410例转移性活检的深度基因组分析,研究TP53与RB1联合缺失与前列腺癌表型的关系,发现40%的TP53/RB1缺陷肿瘤仍为AR活性腺癌,且TP53/RB1缺失表达特征与AR拮抗剂反应减弱和生存期缩短相关。数据可用于前列腺癌耐药与神经内分泌分化相关表达特征的分析(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Mar 20 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):携带强效抑癌基因TP53和RB1缺失的前列腺癌(PC)预后不良,包括对雄激素受体(AR)通路拮抗剂耐药。TP53和RB1还影响细胞可塑性,并且常在伴有神经内分泌(NE)分化的PC中缺失。针对这些侵袭性变异型PC的治疗策略亟需开发。利用对410例转移性活检的深度基因组分析,我们确定了TP53和RB1联合缺失与PC表型之间的关系。值得注意的是,40%的TP53/RB1缺陷肿瘤被归类为AR活性腺癌,表明NE分化并非TP53/RB1失活的必然结果。反映TP53/RB1缺失的基因表达特征与AR拮抗剂反应减弱和生存期缩短相关。这些肿瘤表现出高增殖率以及 elevated 的证据
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL16791、9606。本站分类:肿瘤/前列腺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE147250
【使用注意】
· 源站最后修改于 Feb 05 202,引用时请注意版本时效。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE147250
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
丧失强效肿瘤抑制因子TP53和RB1的前列腺癌(PC)预后不良,包括对雄激素受体(AR)通路拮抗剂耐药。TP53和RB1还影响细胞可塑性,并且在具有神经内分泌(NE)分化的前列腺癌中经常缺失。亟需针对这些侵袭性变异型前列腺癌的治疗策略。通过对410例转移性活检进行深度基因组分析,我们确定了TP53和RB1联合缺失与前列腺癌表型之间的关系。值得注意的是,40%的TP53/RB1缺陷肿瘤被归类为AR活性腺癌,表明NE分化并非TP53/RB1失活的必然结果。反映TP53/RB1缺失的基因表达特征与对AR拮抗剂反应减弱和生存期缩短相关。这些肿瘤表现出高增殖率以及DNA修复过程增强的证据。虽然缺乏TP53/RB1的肿瘤细胞对所有单药治疗均高度耐药,但药理学PARP和ATR抑制的联合产生了显著反应,反映出由复制应激产生的临床可利用的脆弱性。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失?
依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。




