人前列腺癌骨转移具有可干预的免疫抑制微环境
该数据集来自 NCBI GEO(GSE143791),聚焦人前列腺癌骨转移的免疫抑制微环境。研究采集同一患者体内的实体转移组织、转移灶液体骨髓及远离肿瘤部位的椎体液体骨髓,并以髋关节置换患者的骨髓作为良性对照,所有样本均采用单细胞 RNA-seq 评估转录组成

基本信息
资源简介
人前列腺癌骨转移具有可干预的免疫抑制微环境
Human prostate cancer bone metastases have an actionable immunosuppressive microenvironment
该数据集来自 NCBI GEO(GSE143791),聚焦人前列腺癌骨转移的免疫抑制微环境。研究采集同一患者体内的实体转移组织、转移灶液体骨髓及远离肿瘤部位的椎体液体骨髓,并以髋关节置换患者的骨髓作为良性对照,所有样本均采用单细胞 RNA-seq 评估转录组成。数据可用于比较同一体内不同组织组分的转录特征、识别免疫抑制相关细胞群与基因表达模式,并为探索可干预的微环境靶点提供表达谱资源(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Jan 16 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):我们从每位患者采集了独特的组织组分集合:实体转移组织(Tumor fraction)、转移部位的液体骨髓(Involved),以及远离肿瘤部位的椎体液体骨髓(Distal)。这允许在同一个体内进行比较,控制个体间变异。来自接受髋关节置换手术患者的骨髓样本(Benign)作为非恶性对照组。所有样本的转录组成均使用单细胞 RNA-seq(scRNA-seq)进行评估。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL9052、9606。本站分类:肿瘤/前列腺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE143791
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jan 08 202,引用时请注意版本时效。
下载信息
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
我们从每位患者中采集了独特的组织组分样本:实体转移组织(肿瘤组分)、转移部位的液体骨髓(受累组分),以及远离肿瘤部位的椎体液体骨髓(远端组分)。这允许在同一个体内进行比较,从而控制个体间差异。接受髋关节置换手术患者的骨髓样本(良性组)作为非恶性对照组。所有样本的转录组成通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)进行评估。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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