前列腺癌细胞系PC3中JunD敲低与对照的表达数据

该数据集来源于NCBI GEO,收录了前列腺癌细胞系PC3在JunD敲低与对照条件下的基因表达谱数据,采用GPL570芯片平台,物种为9606(人类)

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基因组分类Expression profiling by arrayGPL5709606
GSE118123: Expression data from prostate cancer cell line PC3 with JunD knockdown and control cells

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-11

资源简介

前列腺癌细胞系PC3中JunD敲低与对照的表达数据

Expression data from prostate cancer cell line PC3 with JunD knockdown and control cells

该数据集来源于NCBI GEO,收录了前列腺癌细胞系PC3在JunD敲低与对照条件下的基因表达谱数据,采用GPL570芯片平台,物种为9606(人类)。数据包含1个文件,即GSE118123_series_matrix.txt.gz。JunD作为AP1转录因子,在前列腺癌细胞增殖及细胞周期相关基因调控中起重要作用。该数据可用于比较JunD敲低后PC3细胞的基因表达变化,分析受JunD调控的增殖与细胞周期相关通路,为前列腺癌发生机制研究提供转录组层面的支持(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Aug 03 201。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):前列腺癌的发生伴随着不受控制的细胞增殖,最终导致高度侵袭性导管内癌的形成。前列腺中癌变的起始主要依赖于控制细胞增殖的基因失调,进而导致细胞周期进程抑制性控制的丧失或刺激细胞增殖因子的上调。JunD是一种AP1转录因子,已被证明在前列腺癌细胞的细胞增殖以及细胞周期进程所需基因的调控中发挥重要作用。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by array、GPL570、9606。本站分类:肿瘤/前列腺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE118123

【使用注意】

· 源站最后修改于 Aug 07 201,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

前列腺癌的发展伴随着细胞不受控制的增殖,最终导致高度侵袭性导管内癌的形成。前列腺中癌变的起始主要依赖于控制细胞增殖的基因失调,进而导致细胞周期进程抑制性控制丧失或刺激细胞增殖因子上调。JunD,作为一种AP1转录因子,已被证实对前列腺癌细胞的增殖及细胞周期进程所需基因的调控起着至关重要的作用。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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