GSE108309：PPAR[gamma]2 在人前列腺癌中发挥肿瘤抑制作用

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE108309

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

核受体PPAR[γ]是控制前列腺能量代谢和细胞命运的主调控因子。研究采用一种晚期人前列腺癌细胞系PC3来检测恢复PPAR[γ]2作用的效果。在PC3细胞中恢复PPAR[γ]2作用可抑制细胞增殖和迁移。经H&E染色显示，PC3-PPAR[γ]2 cDNA重组体在癌区域出现坏死，周围基质中有淋巴细胞浸润。与对照组相比，免疫组化染色显示这些重组体微管相关蛋白1轻链3（LC3）表达低，而混合谱系激酶结构域样蛋白（MLKL）、CD4和CD8蛋白表达水平高。微阵列分析表明，PC3细胞中PPAR[γ]2的功能获得导致脂质和能量代谢相关信号通路重编程。这些数据支持以下观点：PPAR[γ]2特异性的PPAR[γ]作用在人前列腺癌的发生和进展中通过触发自噬和坏死性凋亡发挥关键的肿瘤抑制作用。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。