从遗传风险因素到治疗靶点：CREB3L4-GDF15轴驱动前列腺癌进展与免疫逃逸

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3Aff761927a868083df2d607aeabb55645ecce9dfb1e204cb3ecb4307e06ad2bf4

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数据说明

前列腺癌的持续进展及其免疫抑制微环境是晚期预后不良的关键因素。确定克服治疗耐药和免疫无应答的治疗靶点至关重要。通过整合蛋白质基因组学分析，包括在438,178名多族裔男性中进行的孟德尔随机化和共定位分析，我们确定CREB3L4是前列腺癌的重要风险因素和潜在治疗靶点。结合转录组和表观基因组测序的机制研究表明，CREB3L4转录激活胆固醇合成途径，为瘤内雄激素合成和AR通路激活提供前体。药理学抑制胆固醇生物合成有效阻断了这一致癌轴。人前列腺肿瘤的单细胞RNA测序表明，CREB3L4在腔上皮细胞中特异性过表达。

相互作用分析与共培养实验……，# 从遗传风险因素到治疗靶点：CREB3L4-GDF15轴驱动前列腺癌进展与免疫逃逸 数据集DOI：10.5061/dryad.rxwdbrvqm ## 数据与文件结构说明 本数据集包括CREB3L4敲低后LNCaP细胞的ATAC-seq bigwig文件，以及使用Tet-On多西环素系统过表达CREB3L4后Myc-CaP细胞的bulk RNA-seq计数矩阵。 ### 文件：NC.bw 描述： 未敲低CREB3L4的LNCaP细胞（对照组）ATAC-seq数据的bigwig文件，由Illumina NovaSeq原始数据生成。 ### 文件：si_CREB3L4.bw 描述： 敲低CREB3L4的LNCaP细胞ATAC-seq数据的bigwig文件，由Illumina NovaSeq原始数据生成。 ### 文件：tet_on-DOX__(CREB3L4-overexpression_in_Myc-CaP)_gene_count_matrix.csv 描述： 来自Myc-CaP小鼠前列腺癌细胞的RNA测序数据

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。