42例前列腺癌样本表达数据：16例复发与26例无复发

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-18916

标准获取流程：

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2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们分析了64例前列腺癌原发肿瘤样本的蛋白质编码和非编码基因表达谱。所有样本均于1998年至2001年间采集，并获得了在圣保罗Sirio-Libanes医院接受根治性前列腺切除术的患者的知情同意。入选患者被确诊为临床T1-2期前列腺癌，无淋巴结受累，并且在无复发期间未接受术后辅助治疗。生化复发定义为前列腺切除术后5年随访期间任何时间患者血液中PSA水平升高至每毫升血液0.2纳克。对于此类实验，也称为自-自杂交，微阵列与每个Cy3和Cy5标记的cRNA重复样本共杂交。该策略已被用于在比较基因组杂交（CGH）研究中得出强度依赖性截断值，以将基因分类为差异表达或 divergent。恒定倍数变化截断值与强度依赖性截断值的比较分析已被广泛讨论，显示出强度依赖性策略的优越性能。

在此，我们描述了一个由32个蛋白编码mRNA和6个内含子非编码RNA（ncRNA）组成的基因表达谱，该表达谱能有效地根据根治性前列腺切除术后5年内患者的生化复发状态，对42例前列腺癌样本进行分类。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。