前列腺癌骨转移骨髓区室NK标注细胞探索性单细胞分析数据集
该数据集来自 doi.org，为前列腺癌骨转移研究中的探索性单细胞分析数据，包含 1 个 xlsx 文件。研究基于含 920,521 个细胞的整合前列腺癌图谱，其中 38,842 个为 NK 标注细胞，来自 126 个样本标识，重点分析一个含 16 名受试者、32 个样本的骨髓队列，比较骨转移患者远
基本信息
资源简介
前列腺癌骨转移骨髓区室NK标注细胞探索性单细胞分析数据集
Exploratory Single-Cell Analysis of NK-Annotated Cells Across Marrow Compartments in Prostate Cancer Bone Metastasis
该数据集来自 doi.org，为前列腺癌骨转移研究中的探索性单细胞分析数据，包含 1 个 xlsx 文件。研究基于含 920,521 个细胞的整合前列腺癌图谱，其中 38,842 个为 NK 标注细胞，来自 126 个样本标识，重点分析一个含 16 名受试者、32 个样本的骨髓队列，比较骨转移患者远端骨髓与髋关节置换对照的非恶性骨髓，并以样本或受试者为重复单元进行组成、pseudobulk 表达、通路及微环境分析。数据可用于 NK 细胞相关组成与表达分析（来源 figshare，CC BY 4.0 许可）。
【数据集背景】
配套论文《Exploratory Single-Cell Analysis of NK-Annotated Cells Across Marrow Compartments in Prostate Cancer Bone Metastasis》发表于 Cancer Investigation（2026），DOI：10.1080/07357907.2026.2744214。项目资助方：Supported by National High Level Hospital Clinical Research Funding (2025-LYZX-C-A04).。源站首次发布：2026-10-13。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：前列腺癌优先定植于骨，骨髓各区室在组织结构和免疫组成上存在差异。我们重新分析了一个包含 920,521 个细胞的整合前列腺癌图谱，其中含来自 126 个样本标识的 38,842 个 NK 标注细胞，重点聚焦一个由 16 名受试者和 32 个样本组成的骨髓队列。将骨转移患者的远端骨髓与无关髋关节置换对照的非恶性骨髓进行比较，同时使用完整的患者内配对进行局部比较。样本或受试者水平的组成、pseudobulk 表达、通路和微环境分析以生物学单元而非细胞作为重复。继承的 CytokNKs_GZMH 标签在远端骨髓中比对照更常见（25.4% 对 2.0%；中心化对数比效应 2.82；错误发现率 0.0367）。配对肿瘤对远端比较显示更高的相对丰度
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 505.19 KB。数据集 DOI：10.6084/m9.figshare.34425434.v1。
【主题与分类】
源站学科分类：Cell Biology、Genetics、Biological Sciences not elsewhere classified、Cancer。主题标签：Prostate cancer、Bone metastasis、Natural killer cells、Single-cell RNA sequencing、Pseudobulk、Tumor microenvironment。本站分类：肿瘤/前列腺癌。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Cell Biology、Genetics、Biological Sciences not elsewhere classified、Cancer。
【获取与许可】
源站页面：https://tandf.figshare.com/articles/dataset/Exploratory_Single-Cell_Analysis_of_NK-Annotated_Cells_Across_Marrow_Compartments_in_Prostate_Cancer_Bone_Metastasis/34425434
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Exploratory Single-Cell Analysis of NK-Annotated Cells Across Marrow Compartments in Prostate Cancer Bone Metastasis. Taylor & Francis. Pan, Kehao; Xing, Nianzeng
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源站：https://doi.org/10.6084/m9.figshare.34425434
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 505.2 KB。
数据说明
前列腺癌优先定植于骨，而骨髓各腔室在组织结构和免疫组成上存在差异。我们重新分析了一个整合了920，521个细胞的前列腺癌图谱，其中包含来自126个样本标识的38，842个注释为NK的细胞，重点关注一个由16名受试者和32份样本组成的骨髓队列。我们将骨转移患者的远端骨髓与无关的髋关节置换对照者的非恶性骨髓进行比较，同时使用完整的患者内配对进行局部比较。样本或受试者水平的组成、伪批量表达、通路和微环境分析均以生物学单位而非细胞作为重复。遗传的CytokNKs_GZMH标签在远端骨髓中比对照组更常见（25.4%对2.0%；中心对数比效应2.82；错误发现率0.0367）。配对肿瘤与远端比较显示，在10%错误发现阈值下，ImmSuppNKs_CREM的相对丰度较高，而其他几个遗传标签的比例较低。汇总比较在RegNKs_IL7R中识别出62个差异基因，并生成了一个24基因的探索性程序；仅远端模型没有基因达到联合 cutoff。
频繁检出T细胞和髓系标志物，使得该细胞群无法被确定为经验证的NK亚群。发现队列内的程序分离受基因选择偏倚影响，未能确立预测性能。全图谱分析描述了与区室相关的组成差异及候选配体–受体表达对。供者特征、治疗、采样部位、标本处理及注释不确定性仍是尚未解决的混杂来源。这些发现是在回收的NK注释细胞中产生的假设生成性关联，并非转移特异性场效应、调节性NK细胞群或临床实用性的证据。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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