前列腺癌患者直肠轮廓形变配准数据集:37例患者373个轮廓
患者曾参与一项大分割放疗联合整合加量的研究。每个患者有 1 次计划 CT 及 6-10 次放疗期间的重复 CT 扫描,直肠由专家物理师在每次扫描上勾画

基本信息
资源简介
前列腺癌患者直肠轮廓形变配准数据集:37例患者373个轮廓
Deform-registered rectal contours for prostate cancer patients - 373 contours from 37 patients
该数据集包含来自 Haukeland University Hospital 2007-2009 年间 37 例前列腺癌患者的直肠轮廓,共 373 个轮廓。患者曾参与一项大分割放疗联合整合加量的研究。每个患者有 1 次计划 CT 及 6-10 次放疗期间的重复 CT 扫描,直肠由专家物理师在每次扫描上勾画。轮廓以多面体表示,每个形状由 18063 个带 x、y、z 坐标的表面点及 36168 个三角面片构成,所有轮廓均已形变配准至参考形状,可用于放疗中直肠形变与轮廓变化研究(来源 DOI 解析)。
【数据集背景】
源站首次发布:2023。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):37 例前列腺癌患者直肠的轮廓,来自 Haukeland University Hospital 2007-2009 年。这些患者是一项大分割放疗联合整合加量研究的一部分,如 Ekanger et al. (2018) 所述。由于识别密钥已被删除,数据现已完全匿名。每位患者有一次计划 CT 以及放疗过程中 6-10 次重复 CT 扫描。直肠由一位专家物理师在每次扫描上勾画。轮廓以多面体表示,每个形状轮廓由一组 18063 个点组成,带有 x、y 和 z 坐标,位于器官表面。这些点由 36168 个三角面片连接在一起。三角面片的定义由指向轮廓点数组的索引数组给出。所有轮廓均已形变配准至参考形状;因此,存在点对点
【主题与分类】
主题标签:Medicine, Health and Life Sciences、Radiotherapy、Prostatic Neoplasms、Rectum、Contours、Deformable registration。本站分类:肿瘤/前列腺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://dataverse.no/citation?persistentId=doi:10.18710/DKVPIJ
下载信息
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数据集获取
源站:https://doi.org/10.18710/DKVPIJ
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
2007至2009年间,来自豪克兰大学医院的37位前列腺癌患者的直肠轮廓数据。这些患者参与了一项关于大分割放疗联合整合加量的研究,详情见Ekanger等人(2018)的描述。目前,数据已完全匿名化处理,因为识别密钥已被删除。每位患者在进行放疗期间,不仅有一次规划CT扫描,还接受了6至10次重复CT扫描。每次扫描均由专业物理学家勾勒出直肠轮廓。这些轮廓以多面体形式表示,每个形状轮廓由18063个点组成,这些点带有x、y、z坐标,位于器官表面。这些点通过36168个三角形面相互连接。三角形面的定义通过一个索引数组给出,该数组指向轮廓点数组。所有轮廓均已通过可变形配准至参考形状,因此,数据集中所有形状之间存在点对点的对应关系,这使得数据非常适合进行统计建模。此数据曾被Rørtveit等人(2021年)和Rørtveit等人(2023年)的模型所使用。关于患者、治疗及影像的详细描述,参见Hysing等人(2018年)的文献。
该数据集提供了两种数据表示形式:首先是包含所有数据的Matlab .mat文件。对于不使用Matlab的用户,数据也以逗号分隔值的文本文件形式提供。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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