雄激素受体共调节因子激素反应性 LNCaP / GSF

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-4454

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

LNCaP 是表达雄激素受体的前列腺癌细胞。生殖器皮肤成纤维细胞也表达雄激素受体。细胞要么处于增殖状态，要么被阻滞在 G0 期。细胞处理采用雄激素 DHT（二氢睾酮）、雄激素类似物 R1881（甲基三烯醇酮）或溶剂乙醇。部分杂交采用 1 型设计。在这些情况下，激素处理样本与乙醇处理样本杂交在同一微阵列上。激素介导的基因转录诱导或抑制可直接从阵列上的 R/G 归一化比值推断。对于其他实验，乙醇处理对照和激素处理实验分别与 RNA 共同参考杂交在单独的微阵列上。该参考由共同参考批次 CRG（50%）和成纤维细胞 RNA（50%）组成。该参考被称为混合参考。所有实验均使用同一批次的混合参考。化合物处理设计类型是测定对施用化合物或化学物质（包括激素等生物化合物）反应的设计类型。

基于化合物的处理：乙醇、R1881（甲基三烯醇酮）或DHT（二氢睾酮）细胞系：LNCaP（前列腺癌）或包皮成纤维细胞培养同步化：增殖/Go期停滞计算

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。