以eIF1A+管腔细胞为中心的统一缺氧与冷肿瘤微环境促进不同亚型PCa进展

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3A37c3a8be22c8ad0b4e3e7cfa8740933379605021dee74d9e0dd19b7086e0f0c1

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数据说明

前列腺癌（PCa）是一种高度异质性的恶性肿瘤，其异质性源于肿瘤微环境（TME）和组织学亚型。为实现更优的临床疗效，亟需在如此异质性中识别统一的进展驱动因素。本研究应用成像质谱流式技术对癌旁组织、低级别腺泡腺癌（LgPAC）、高级别腺泡腺癌（HgPAC）、导管内癌（IDC）和导管腺癌（DAC）组织中的38种蛋白质进行染色，发现已知的致癌因子（如BRCA1、PSMA）在区分前列腺癌预后方面能力有限；相比之下，eIF1A——一种关键的翻译起始因子——在包括HgPAC、IDC和DAC在内的高危亚型中特异性过表达，并与肿瘤进展和不良预后相关。

eIF1A + 管腔上皮（LE）显示 HIF-1α 及其下游靶点表达升高，同时抗癌免疫细胞（包括 PD1 -…）的空间排斥增加，# 一个统一的 eIF1A ^+^ 管腔细胞为中心的低氧和“冷”肿瘤微环境促进不同亚型中 PCa 的进展 数据集 DOI：10.5061/dryad.tqjq2bwb3 ## 数据和文件结构描述 该数据集包括通过成像质谱流式细胞术（IMC）获得的 71 个 ROI 中 38 种蛋白质的空间蛋白质组数据。该数据集还包括 10 例术后前列腺癌组织的单细胞 RNA 测序（4 例接受新辅助雄激素剥夺治疗 [ADT]，4 例接受 HHT + ADT 治疗，2 例未接受治疗）。此外，该数据集包含来自 Myc-CaP 皮下肿瘤的 RNA 测序数据，包括 HHT+ADT 对比 vehicle 以及 sh-EIF1A 对比 sh-NC。 ### 文件和变量 #### 文件：IMC_profiling.csv 描述： 所有 ROI 中每个细胞的靶蛋白表达水平。成像质谱流式细胞术（IMC）在前列腺癌肿瘤组织芯片上进行。表达水平代表经过标度化的“背景…

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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