PXD040744原发性中枢神经系统淋巴瘤脑脊液外泌体磷酸化蛋白组数据集
基于EVTRAP和timsTOF Pro分析PCNSL与非PCNSL脑脊液外泌体磷酸化蛋白组。由jPOST提供，来自ProteomeXchange，数据格式为表格，适用于分类任务，专注于肿瘤领域的原发性中枢神经系统淋巴瘤研究。
基本信息
资源简介
PXD040744原发性中枢神经系统淋巴瘤脑脊液外泌体磷酸化蛋白组数据集
【一句话概览】
原发中枢神经系统淋巴瘤占中枢神经系统肿瘤的3%至4%。近期研究强调脑脊液来源细胞外囊泡在该病中的重要性。细胞外囊泡是几乎所有细胞类型释放的具双层脂膜纳米级囊泡，存在于尿液、血液和脑脊液等体液中。脑脊液来源囊泡含神经元、少突胶质细胞、星形胶质细胞和小胶质细胞蛋白，其研究主要受每毫升脑脊液囊泡分离量及单例患者脑脊液获取量限制。本研究采用EVTRAP功能磁珠联合高灵敏timsTOF Pro，对原发中枢神经系统淋巴瘤与非该病脑脊液样本分离的囊泡进行无标记定量磷酸化蛋白质组分析（来源 ProteomeXchange）。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Phosphoproteome Analysis of Cerebrospinal Fluid Extracellular Vesicles in Primary Central Nervous System Lymphoma》。
【数据内容】
源站原始描述：s lymphoma and accounts for 3%-4% of central nervous system tumors. Recent studies have highlighted the importance of cerebrospinal fluid derived extracellular vesicles in PCNSL. Extracellular vesicles(EVs) are nanoscale vesicles with bilayer lipid membrane released by almost all cell types. EVs are present in body fluids, including urine, blood and CSF. Cerebrospinal fluid(CSF) is a colorless fluid that surrounds the brain and spinal cord and acts as lymph in the central nervous system. CSF-der…
中文译文（机器翻译，仅供快速理解，请以原文为准）：淋巴瘤，占中枢神经系统肿瘤的3%-4%。近期研究强调了脑脊液来源的细胞外囊泡在PCNSL中的重要性。细胞外囊泡（EVs）是由几乎所有细胞类型释放的具有双层脂质膜的纳米级囊泡。EVs存在于体液中，包括尿液、血液和脑脊液。脑脊液（CSF）是一种无色液体，环绕大脑和脊髓，在中枢神经系统中起到淋巴的作用。CSF来源的EVs含有来自神经元、少突胶质细胞、星形胶质细胞和小胶质细胞的蛋白质。对CSF EVs的研究主要受限于每毫升CSF中分离出的EVs量以及从单个患者获取的CSF体积。在此，我们通过先前引入的名为EVTRAP的功能性磁珠结合高灵敏度的timsTOF Pro，提供了从PCNSL和非PCNSL CSF样本中分离出的EVs的无标记定量磷酸化蛋白质组分析。
【数据结构与技术规格】
文件数 2 个。
【主题与分类】
主题标签：PCNSL, Human, CSF, EV, Phosphoproteome、Homo sapiens (Human)、9606。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面：https://proteomecentral.proteomexchange.org/dataset/PXD040744
规范引用：37403840
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://proteomecentral.proteomexchange.org/cgi/GetDataset?ID=PXD040744
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
基于EVTRAP和timsTOF Pro分析PCNSL与非PCNSL脑脊液外泌体磷酸化蛋白组。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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