大鼠嗜铬细胞瘤PC12细胞系低剂量与高剂量三甲基锡处理转录谱

主题标签:嗜铬细胞瘤、PC12细胞系、三甲基锡、转录谱、大鼠、肿瘤。本站分类:肿瘤/嗜铬细胞瘤。本数据集为肿瘤领域公开数据集,主题涵盖嗜铬细胞瘤。

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基因组分类嗜铬细胞瘤PC12细胞系三甲基锡转录谱大鼠肿瘤
Transcription profiling of rat at pheochromocytoma cell line PC12 treated with trimethyltin at low and high doses

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-27

资源简介

大鼠嗜铬细胞瘤PC12细胞系低剂量与高剂量三甲基锡处理转录谱

该数据集为肿瘤领域的公开转录谱数据集,英文名称为“Transcription profiling of rat at pheochromocytoma cell line PC12 treated with trimethyltin at low and high doses”,在来源站点的分类归属为肿瘤 / 嗜铬细胞瘤。数据集围绕大鼠嗜铬细胞瘤细胞系 PC12 展开,采用转录谱(转录组表达谱)技术,考察该细胞系在低剂量与高剂量三甲基锡处理条件下的基因表达变化情况。其主题标签涵盖嗜铬细胞瘤、PC12 细胞系、三甲基锡、转录谱、大鼠与肿瘤,可用于了解三甲基锡暴露对嗜铬细胞瘤细胞转录水平的影响。数据集来源于 ebi.ac.uk,原始记录由 Camilla Bernardini 于 2009 年发布,可通过 ArrayExpress 实验编号 E-GEOD-5073 定位。

【数据集背景】

嗜铬细胞瘤是起源于嗜铬细胞的肿瘤,PC12 细胞系是大鼠嗜铬细胞瘤来源的常用细胞模型。该数据集以这一细胞模型为研究对象,关注三甲基锡在低剂量和高剂量两种处理条件下引起的转录谱变化。数据集的主题标签明确包含嗜铬细胞瘤、PC12 细胞系、三甲基锡、转录谱、大鼠和肿瘤,说明其研究背景落在肿瘤学与毒理相关的转录组分析交叉领域。源站描述给出了数据集的正式题名与发布信息,题名直接点明“大鼠嗜铬细胞瘤细胞系 PC12 经低剂量和高剂量三甲基锡处理后的转录谱分析”。

【数据内容】

数据集的核心内容是转录谱数据,即针对大鼠嗜铬细胞瘤细胞系 PC12 在低剂量与高剂量三甲基锡处理条件下获得的转录组表达谱。题名表明实验设计包含两个剂量水平(低剂量与高剂量)的处理组。关于具体的样本数量、检测平台、基因数量、差异表达基因列表、表达量数值等细节,源站未提供。

【采集与来源】

数据集来源于 ebi.ac.uk,源站描述中给出的引用信息为:Camilla Bernardini (2009). Transcription profiling of rat at pheochromocytoma cell line PC12 treated with trimethyltin at low and high doses [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-GEOD-5073。据此可知数据集于 2009 年发布,发布者为 Camilla Bernardini,记录位于 ArrayExpress 平台,实验编号为 E-GEOD-5073。关于样本制备、测序或芯片平台、数据处理流程等采集细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于肿瘤领域中与嗜铬细胞瘤相关的研究场景,尤其是以大鼠 PC12 细胞系为模型的转录谱分析。由于数据集涉及低剂量与高剂量三甲基锡处理,可用于考察不同剂量暴露下 PC12 细胞转录水平的响应差异。其主题标签涵盖转录谱、三甲基锡与大鼠,也可作为毒理转录组学或细胞模型表达谱研究的参考数据。关于具体可支持的统计分析方法或验证结论,源站未提供。

【使用方法】

数据集可通过来源站点 ebi.ac.uk 上的 ArrayExpress 实验编号 E-GEOD-5073 进行访问与获取。使用时应依据源站提供的实验描述理解低剂量与高剂量三甲基锡处理的设计。关于数据下载格式、预处理步骤、分析工具与参数设置等具体使用方法,源站未提供。

【质量与限制】

数据集为 2009 年发布的公开转录谱数据集,来源站点为 ebi.ac.uk。关于数据质量评估指标、样本量、重复数、平台版本、数据完整性及已知技术限制等信息,源站未提供。使用者在解读结果时需注意数据集仅涉及大鼠 PC12 细胞系这一体外模型,其结论向其他细胞类型或体内情境的外推需谨慎,但源站未提供具体的局限性说明。

【引用与许可】

引用信息为:Camilla Bernardini (2009). Transcription profiling of rat at pheochromocytoma cell line PC12 treated with trimethyltin at low and high doses [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-GEOD-5073。关于该数据集的许可条款与使用限制,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-GEOD-5073

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Camilla Bernardini (2009). Transcription profiling of rat at pheochromocytoma cell line PC12 treated with trimethyltin at low and high doses [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-GEOD-5073

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