腹膜癌病全外显子测序样本数据集
该数据集来自 omicsdi.org，聚焦肿瘤领域的腹膜癌病（PC），收录了 34 例 PC 样本的全外显子测序（WES）数据，其中 15 例配有从血液中提取的配对 gDNA
基本信息
资源简介
腹膜癌病全外显子测序样本数据集
该数据集聚焦于肿瘤领域的腹膜癌病（Peritoneal Carcinomatosis，PC），收录了 34 例 PC 样本的全外显子测序（WES）数据。全外显子测序是一种针对基因组中蛋白编码区域的测序策略，能够有效捕获与肿瘤发生发展相关的编码区变异信息。在这 34 例样本中，有 15 例同时配备了从血液中提取的配对 gDNA（生殖系 DNA），使得研究者可以在个体层面区分肿瘤组织中的体细胞突变与生殖系变异。数据集来源于 omicsdi.org，主题标签为 Genomics，属于肿瘤基因组学研究中较为典型的腹膜癌病测序资源。整体而言，该数据集为腹膜癌病的基因组变异研究提供了以全外显子测序为核心的数据基础，尤其适合关注体细胞突变谱与配对生殖系对照的研究方向。
【数据集背景】
腹膜癌病是肿瘤领域中的一种重要临床表型，通常指恶性肿瘤在腹膜表面的播散与种植。该数据集以腹膜癌病为分类核心，通过全外显子测序手段对 34 例 PC 样本进行基因组层面的刻画。数据集的来源站为 omicsdi.org，主题标签为 Genomics，表明其定位属于基因组学数据资源。源站描述明确指出，全外显子测序是针对 PC 样本开展的，并且部分病例配有从血液中提取的配对 gDNA。这一背景信息说明该数据集的设计目标在于从编码区层面获取腹膜癌病样本的遗传变异信息，并通过配对设计增强变异解读的可靠性。
【数据内容】
该数据集包含 34 例腹膜癌病（PC）样本的全外显子测序数据。全外显子测序覆盖基因组中的蛋白编码区域，因此数据内容主要围绕这些样本的外显子区域序列信息展开。在 34 例样本中，有 15 例同时具备从血液中提取的配对 gDNA。配对 gDNA 的存在意味着这 15 例样本可以形成肿瘤样本与正常对照的配对关系，从而支持体细胞变异的识别与过滤。其余样本是否具有配对 gDNA，源站未提供。数据集的主题标签为 Genomics，进一步表明其内容属于基因组学范畴。除上述信息外，关于测序深度、覆盖度、变异类型、数据文件格式等具体内容，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 omicsdi.org。根据源站描述，全外显子测序共对 34 例 PC 样本进行，其中 15 例的配对 gDNA 从血液中提取。这说明样本采集涉及腹膜癌病标本以及部分病例的血液样本。血液来源的 gDNA 通常作为生殖系对照使用，用于辅助区分肿瘤中的体细胞突变与个体固有的生殖系变异。关于样本的具体采集地点、采集时间、伦理审批信息、样本处理流程以及测序平台等细节，源站未提供。
【适用场景】
基于该数据集的内容特征，其适用场景主要包括：腹膜癌病的全外显子水平变异研究，尤其是针对蛋白编码区突变的探索；利用 15 例配对 gDNA 样本进行体细胞突变与生殖系变异的区分分析；在肿瘤基因组学研究中作为腹膜癌病样本的 WES 数据资源，用于突变谱描述、候选基因筛选或与其他肿瘤类型进行对比分析等。由于数据集主题标签为 Genomics，其适用方向集中在基因组学分析层面。关于该数据集是否适用于特定临床决策、预后评估或治疗靶点验证，源站未提供相关信息。
【使用方法】
该数据集的使用需围绕全外显子测序数据展开。对于 15 例配有血液来源配对 gDNA 的样本，可采用配对分析策略，将肿瘤样本的 WES 数据与对应生殖系对照进行比较，以识别体细胞变异。对于其余样本，由于配对信息源站未提供，其使用方式需依据实际数据情况而定。数据下载、访问权限、所需分析工具与流程等具体使用方法，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集包含 34 例 PC 样本的 WES 数据，其中 15 例具有配对 gDNA。配对样本的存在有助于提高体细胞变异检测的可靠性。然而，关于测序质量指标（如深度、覆盖均一性、碱基质量等）、样本纳入标准、数据完整性以及潜在批次效应等信息，源站未提供。此外，34 例样本的规模相对有限，且并非全部样本均具备配对对照，这些因素可能对变异解读的全面性构成限制。除上述内容外，其他质量与限制相关信息，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集的来源站为 omicsdi.org。关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款以及是否存在访问限制等信息，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001004364
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
对总共34例前列腺癌标本进行了全外显子组测序（WES），其中15例有从血液中提取的匹配gDNA。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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